59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2988 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_3008  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  265  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2988  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  265  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2374  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  265  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566421  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2898  hypothetical protein  99.09 
 
 
110 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3035  hypothetical protein  99.09 
 
 
110 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6337  hypothetical protein  98.18 
 
 
110 aa  216  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2982  hypothetical protein  93.64 
 
 
110 aa  206  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2723  hypothetical protein  69.75 
 
 
113 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0721067  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1109  hypothetical protein  69.75 
 
 
113 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2876  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  70 
 
 
108 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3307  hypothetical protein  52.94 
 
 
109 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275634  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3853  hypothetical protein  50 
 
 
109 aa  90.1  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1357  hypothetical protein  44.21 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.766976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2784  hypothetical protein  40.4 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03386  hypothetical protein  37.61 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.368083  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2102  hypothetical protein  40.43 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1956  hypothetical protein  37.76 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0232932  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0642  hypothetical protein  35.92 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1398  hypothetical protein  36.56 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0120742  normal  0.0453479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0303  cupredoxin domain-containing protein  41.24 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3151  hypothetical protein  37.23 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1069  hypothetical protein  37.65 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442035  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0369  hypothetical protein  42.17 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0382  hypothetical protein  28.45 
 
 
132 aa  61.6  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0391  hypothetical protein  33.02 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1111  hypothetical protein  32.69 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.680382  normal  0.270698 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5536  hypothetical protein  37.04 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0913  hypothetical protein  32.88 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.265843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0509  hypothetical protein  32.88 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0013  hypothetical protein  32.88 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0882  hypothetical protein  32.88 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0607  hypothetical protein  32.88 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1741  hypothetical protein  32.88 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169906  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1922  hypothetical protein  32.88 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3632  hypothetical protein  34.83 
 
 
126 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2034  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1305  hypothetical protein  36.71 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302252  normal  0.694847 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5869  hypothetical protein  35.62 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2125  hypothetical protein  35.62 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532168  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2232  hypothetical protein  35.62 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2246  hypothetical protein  35.62 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2208  hypothetical protein  35.62 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3802  hypothetical protein  32.94 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  0.0854826 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4286  hypothetical protein  33.71 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.37235  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0330  hypothetical protein  30.77 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3604  hypothetical protein  34.88 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3504  hypothetical protein  27.96 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3015  hypothetical protein  30 
 
 
123 aa  50.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0676858  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0969  hypothetical protein  34.52 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0555866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1421  hypothetical protein  32.91 
 
 
131 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.753032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1448  hypothetical protein  32.91 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1420  hypothetical protein  32.91 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1561  hypothetical protein  32.91 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1705  hypothetical protein  32.91 
 
 
129 aa  47.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0036195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1632  hypothetical protein  32.91 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0700074 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1667  hypothetical protein  28.95 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3751  hypothetical protein  26.55 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.563383  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1594  hypothetical protein  25.66 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.607033  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  27.83 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>