62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1398 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1398  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  221  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0120742  normal  0.0453479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3151  hypothetical protein  95.45 
 
 
122 aa  210  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1069  hypothetical protein  82.73 
 
 
110 aa  185  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442035  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5536  hypothetical protein  82.73 
 
 
110 aa  176  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2208  hypothetical protein  85.45 
 
 
110 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5869  hypothetical protein  85.45 
 
 
110 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2232  hypothetical protein  85.45 
 
 
110 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2246  hypothetical protein  84.55 
 
 
110 aa  173  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2125  hypothetical protein  84.55 
 
 
110 aa  173  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532168  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1956  hypothetical protein  77.48 
 
 
111 aa  170  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0232932  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1922  hypothetical protein  90 
 
 
109 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0882  hypothetical protein  90 
 
 
109 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0913  hypothetical protein  90 
 
 
109 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.265843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0509  hypothetical protein  90 
 
 
109 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0607  hypothetical protein  90 
 
 
109 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27183  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0013  hypothetical protein  90 
 
 
109 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1741  hypothetical protein  90 
 
 
109 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169906  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2034  hypothetical protein  91.95 
 
 
109 aa  167  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0391  hypothetical protein  62.11 
 
 
116 aa  120  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3604  hypothetical protein  58.33 
 
 
98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1111  hypothetical protein  55.05 
 
 
110 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.680382  normal  0.270698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3632  hypothetical protein  61.05 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4286  hypothetical protein  56.38 
 
 
119 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.37235  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0382  hypothetical protein  50 
 
 
132 aa  104  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0330  hypothetical protein  52.81 
 
 
124 aa  98.2  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3802  hypothetical protein  50.57 
 
 
116 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  0.0854826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3504  hypothetical protein  45.92 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1357  hypothetical protein  39.8 
 
 
113 aa  73.6  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.766976 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2102  hypothetical protein  36.08 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3853  hypothetical protein  43.02 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2784  hypothetical protein  31.96 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3307  hypothetical protein  34.86 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275634  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1109  hypothetical protein  34.74 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2723  hypothetical protein  34.74 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0721067  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6337  hypothetical protein  36 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2876  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  34.74 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2374  hypothetical protein  36.56 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.566421  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3035  hypothetical protein  36.56 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3008  hypothetical protein  36.56 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2898  hypothetical protein  36.56 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2988  hypothetical protein  36.56 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1305  hypothetical protein  36.9 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302252  normal  0.694847 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0969  hypothetical protein  31.58 
 
 
115 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0555866  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0642  hypothetical protein  35.63 
 
 
117 aa  63.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03386  hypothetical protein  36.19 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.368083  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2982  hypothetical protein  33.68 
 
 
110 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0303  cupredoxin domain-containing protein  32.11 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2263  hypothetical protein  35.42 
 
 
376 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2365  hypothetical protein  35.42 
 
 
376 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0102412  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  29.07 
 
 
125 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2041  hypothetical protein  34.38 
 
 
376 aa  44.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.117906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3015  hypothetical protein  28.77 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0676858  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1546  hypothetical protein  30.77 
 
 
375 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391559  normal  0.123429 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1421  hypothetical protein  23.58 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.753032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1420  hypothetical protein  23.58 
 
 
131 aa  41.2  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1448  hypothetical protein  23.58 
 
 
131 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2783  hypothetical protein  30.28 
 
 
373 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1561  hypothetical protein  23.58 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1705  hypothetical protein  23.15 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0036195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3751  hypothetical protein  24.21 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.563383  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2105  hypothetical protein  30.51 
 
 
375 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258925  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2928  hypothetical protein  34.62 
 
 
378 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000108571  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>