34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00356 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00356  putative secreted protein containing plastocyanin domain  100 
 
 
117 aa  242  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.700432  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4144  plastocyanin domain-containing protein  49.14 
 
 
119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9179  normal  0.258983 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0213  plastocyanin domain-containing protein  52.99 
 
 
116 aa  137  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3817  plastocyanin domain-containing putative protein  50.43 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.657288  hitchhiker  0.00963655 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0269  plastocyanin domain-containing protein  49.12 
 
 
116 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2092  hypothetical protein  50.43 
 
 
117 aa  130  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00396  putative secreted protein containing plastocyanin domain  52.29 
 
 
111 aa  122  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1382  protease  45.9 
 
 
122 aa  122  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1995  hypothetical protein  38.66 
 
 
204 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3585  hypothetical protein  31.97 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3654  hypothetical protein  31.97 
 
 
138 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3497  hypothetical protein  30.33 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4378  hypothetical protein  34.62 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188877 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1569  hypothetical protein  32.48 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.117351  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0429  hypothetical protein  29.82 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000714902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1874  cupredoxin-like domain  28.57 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0499393  hitchhiker  0.00000000173475 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0430  hypothetical protein  35.56 
 
 
95 aa  61.6  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000570848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0311  hypothetical protein  34.12 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0239083  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  32.11 
 
 
928 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0300  hypothetical protein  31.87 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1875  cupredoxin-like domain  32 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000550089 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0322  hypothetical protein  30.59 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.512657  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  32.94 
 
 
902 aa  51.6  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0125  hypothetical protein  31.82 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.933361  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0132  hypothetical protein  29.55 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0143  hypothetical protein  29.55 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3853  hypothetical protein  36.9 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5742  hypothetical protein  22.62 
 
 
311 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1705  hypothetical protein  26.58 
 
 
129 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0036195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1421  hypothetical protein  26.58 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.753032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1561  hypothetical protein  26.58 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1420  hypothetical protein  26.58 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1448  hypothetical protein  26.58 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1632  hypothetical protein  26.58 
 
 
129 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0700074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>