32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1569 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1569  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  313  4e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.117351  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1995  hypothetical protein  63.64 
 
 
204 aa  184  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4378  hypothetical protein  52.08 
 
 
170 aa  151  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188877 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3497  hypothetical protein  43.44 
 
 
130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  44.83 
 
 
928 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3654  hypothetical protein  40.16 
 
 
138 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3585  hypothetical protein  40.16 
 
 
130 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2120  copper-translocating P-type ATPase  41.12 
 
 
918 aa  89.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.440139  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4144  plastocyanin domain-containing protein  40.17 
 
 
119 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9179  normal  0.258983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1382  protease  37.5 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1874  cupredoxin-like domain  35.24 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0499393  hitchhiker  0.00000000173475 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0429  hypothetical protein  32.74 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000714902  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  43.02 
 
 
902 aa  75.9  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2092  hypothetical protein  36.04 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0269  plastocyanin domain-containing protein  32.14 
 
 
116 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00356  putative secreted protein containing plastocyanin domain  32.48 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.700432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3817  plastocyanin domain-containing putative protein  33.04 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.657288  hitchhiker  0.00963655 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0213  plastocyanin domain-containing protein  31.82 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00396  putative secreted protein containing plastocyanin domain  32.14 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0132  hypothetical protein  36.05 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0143  hypothetical protein  36.05 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0125  hypothetical protein  34.52 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.933361  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0300  hypothetical protein  37.35 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0322  hypothetical protein  34.94 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.512657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0311  hypothetical protein  33.73 
 
 
145 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0239083  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0430  hypothetical protein  32.89 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000570848  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5742  hypothetical protein  34.94 
 
 
311 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1875  cupredoxin-like domain  31.58 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000550089 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4261  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  29.59 
 
 
471 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  26.83 
 
 
621 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  28.45 
 
 
499 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>