28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0213 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0213  plastocyanin domain-containing protein  100 
 
 		 116 aa  239  6e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3817  plastocyanin domain-containing putative protein  67.24 
 
 		 116 aa  170  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.657288  hitchhiker  0.00963655 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0269  plastocyanin domain-containing protein  65.52 
 
 		 116 aa  169  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1382  protease  54.1 
 
 		 122 aa  143  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00356  putative secreted protein containing plastocyanin domain  52.99 
 
 		 117 aa  137  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.700432  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4144  plastocyanin domain-containing protein  53.45 
 
 		 119 aa  136  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9179  normal  0.258983 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2092  hypothetical protein  52.99 
 
 		 117 aa  127  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00396  putative secreted protein containing plastocyanin domain  55.24 
 
 		 111 aa  124  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1995  hypothetical protein  39.5 
 
 		 204 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3585  hypothetical protein  30.33 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3654  hypothetical protein  30.33 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3497  hypothetical protein  29.51 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  41.76 
 
 		 902 aa  72.8  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4378  hypothetical protein  30.77 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188877 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1569  hypothetical protein  31.82 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.117351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  32.74 
 
 		 928 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0429  hypothetical protein  27.03 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000714902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1874  cupredoxin-like domain  26.67 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0499393  hitchhiker  0.00000000173475 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2120  copper-translocating P-type ATPase  37.8 
 
 		 918 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.440139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0311  hypothetical protein  34.57 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0239083  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5742  hypothetical protein  33.72 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0125  hypothetical protein  32.95 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.933361  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0430  hypothetical protein  32 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000570848  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1875  cupredoxin-like domain  30.21 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000550089 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0132  hypothetical protein  31.82 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0143  hypothetical protein  31.82 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0322  hypothetical protein  30.86 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.512657  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0300  hypothetical protein  30.86 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>