23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00396 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00396  putative secreted protein containing plastocyanin domain  100 
 
 		 111 aa  229  9e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4144  plastocyanin domain-containing protein  55.05 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9179  normal  0.258983 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0213  plastocyanin domain-containing protein  55.24 
 
 		 116 aa  124  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00356  putative secreted protein containing plastocyanin domain  52.29 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.700432  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0269  plastocyanin domain-containing protein  51.43 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3817  plastocyanin domain-containing putative protein  49.07 
 
 		 116 aa  117  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.657288  hitchhiker  0.00963655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2092  hypothetical protein  46.3 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1382  protease  46.09 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1995  hypothetical protein  37.5 
 
 		 204 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3585  hypothetical protein  32.76 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3654  hypothetical protein  32.76 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4378  hypothetical protein  36.54 
 
 		 170 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188877 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3497  hypothetical protein  31.03 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1569  hypothetical protein  32.14 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.117351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  31.58 
 
 		 928 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  34.48 
 
 		 902 aa  55.1  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0125  hypothetical protein  38.75 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.933361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5742  hypothetical protein  34.15 
 
 		 311 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0132  hypothetical protein  37.5 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0429  hypothetical protein  24.77 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000714902  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0143  hypothetical protein  37.5 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1874  cupredoxin-like domain  23.36 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0499393  hitchhiker  0.00000000173475 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0430  hypothetical protein  21.88 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000570848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>