31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3654 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3654  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  277  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3585  hypothetical protein  99.23 
 
 
130 aa  259  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3497  hypothetical protein  93.85 
 
 
130 aa  250  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  45.97 
 
 
928 aa  114  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2120  copper-translocating P-type ATPase  49.54 
 
 
918 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.440139  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1569  hypothetical protein  40.16 
 
 
153 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.117351  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4378  hypothetical protein  38.58 
 
 
170 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188877 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1874  cupredoxin-like domain  42.06 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0499393  hitchhiker  0.00000000173475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1995  hypothetical protein  34.92 
 
 
204 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0429  hypothetical protein  35.48 
 
 
122 aa  93.2  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000714902  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  41.44 
 
 
902 aa  91.7  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4144  plastocyanin domain-containing protein  36.89 
 
 
119 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9179  normal  0.258983 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0269  plastocyanin domain-containing protein  31.97 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00356  putative secreted protein containing plastocyanin domain  31.97 
 
 
117 aa  80.1  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.700432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0213  plastocyanin domain-containing protein  30.33 
 
 
116 aa  77  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3817  plastocyanin domain-containing putative protein  33.04 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.657288  hitchhiker  0.00963655 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1382  protease  31.9 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0300  hypothetical protein  40.79 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2092  hypothetical protein  29.57 
 
 
117 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00396  putative secreted protein containing plastocyanin domain  32.76 
 
 
111 aa  73.6  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0430  hypothetical protein  37.93 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000570848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0311  hypothetical protein  40.79 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0239083  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0322  hypothetical protein  39.47 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.512657  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1875  cupredoxin-like domain  32.56 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000550089 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0125  hypothetical protein  37.5 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.933361  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0132  hypothetical protein  37.66 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0143  hypothetical protein  37.66 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5742  hypothetical protein  36.49 
 
 
311 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4261  hypothetical protein  28.04 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  26.8 
 
 
621 aa  43.9  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0655  hypothetical protein  25.97 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>