29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1874 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1874  cupredoxin-like domain  100 
 
 
125 aa  254  2e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0499393  hitchhiker  0.00000000173475 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0429  hypothetical protein  85.12 
 
 
122 aa  219  7e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000714902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0430  hypothetical protein  53.19 
 
 
95 aa  107  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000570848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3585  hypothetical protein  39.37 
 
 
130 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3654  hypothetical protein  39.84 
 
 
138 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3497  hypothetical protein  37.8 
 
 
130 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1875  cupredoxin-like domain  52.13 
 
 
95 aa  102  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000550089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2120  copper-translocating P-type ATPase  40.95 
 
 
918 aa  96.3  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.440139  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1995  hypothetical protein  34.68 
 
 
204 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  36.29 
 
 
928 aa  91.3  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1569  hypothetical protein  35.96 
 
 
153 aa  90.5  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.117351  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  38.83 
 
 
902 aa  88.2  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0269  plastocyanin domain-containing protein  32.5 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4378  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188877 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4144  plastocyanin domain-containing protein  33.33 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9179  normal  0.258983 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00356  putative secreted protein containing plastocyanin domain  32.46 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.700432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3817  plastocyanin domain-containing putative protein  32.76 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.657288  hitchhiker  0.00963655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2092  hypothetical protein  31.09 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1382  protease  31.4 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0213  plastocyanin domain-containing protein  26.67 
 
 
116 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0311  hypothetical protein  33.75 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0239083  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00396  putative secreted protein containing plastocyanin domain  23.68 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0300  hypothetical protein  32.5 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0322  hypothetical protein  32.5 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.512657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0132  hypothetical protein  32.18 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0143  hypothetical protein  32.18 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0125  hypothetical protein  31.25 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.933361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5742  hypothetical protein  28.38 
 
 
311 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  22.39 
 
 
499 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>