29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1382 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1382  protease  100 
 
 
122 aa  251  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0213  plastocyanin domain-containing protein  54.1 
 
 
116 aa  143  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2092  hypothetical protein  51.64 
 
 
117 aa  136  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3817  plastocyanin domain-containing putative protein  54.1 
 
 
116 aa  131  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.657288  hitchhiker  0.00963655 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0269  plastocyanin domain-containing protein  50 
 
 
116 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4144  plastocyanin domain-containing protein  48.76 
 
 
119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9179  normal  0.258983 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00356  putative secreted protein containing plastocyanin domain  45.9 
 
 
117 aa  122  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.700432  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00396  putative secreted protein containing plastocyanin domain  46.09 
 
 
111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1995  hypothetical protein  37.19 
 
 
204 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1569  hypothetical protein  37.5 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.117351  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4378  hypothetical protein  38.68 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188877 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3585  hypothetical protein  31.9 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3654  hypothetical protein  31.9 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3497  hypothetical protein  32.76 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  28.45 
 
 
928 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  31.19 
 
 
902 aa  63.9  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2120  copper-translocating P-type ATPase  30.48 
 
 
918 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.440139  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0429  hypothetical protein  28.1 
 
 
122 aa  62  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000714902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1874  cupredoxin-like domain  28.97 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0499393  hitchhiker  0.00000000173475 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0311  hypothetical protein  37.35 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0239083  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0322  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.512657  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0300  hypothetical protein  34.94 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0430  hypothetical protein  32 
 
 
95 aa  50.4  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000570848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0125  hypothetical protein  29.76 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.933361  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0132  hypothetical protein  29.76 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0143  hypothetical protein  29.76 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5742  hypothetical protein  26.51 
 
 
311 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1875  cupredoxin-like domain  26.47 
 
 
95 aa  47  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000550089 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4261  hypothetical protein  26.51 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>