66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5742 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5742  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  27.8 
 
 		 621 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  27.61 
 
 		 499 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  29.53 
 
 		 471 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0800  hypothetical protein  31.52 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1245  hypothetical protein  27.89 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1995  hypothetical protein  31.73 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  34.74 
 
 		 928 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1569  hypothetical protein  34.02 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.117351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4144  plastocyanin domain-containing protein  29.52 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9179  normal  0.258983 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4378  hypothetical protein  34.38 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188877 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3585  hypothetical protein  36.49 
 
 		 130 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3654  hypothetical protein  36.49 
 
 		 138 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2120  copper-translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 918 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.440139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0132  hypothetical protein  35.29 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0143  hypothetical protein  35.29 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3497  hypothetical protein  36.49 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0125  hypothetical protein  34.12 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.933361  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2221  hypothetical protein  32.18 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157963  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1922  hypothetical protein  27.33 
 
 		 226 aa  55.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0213  plastocyanin domain-containing protein  34.52 
 
 		 116 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  32.56 
 
 		 902 aa  53.9  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2297  ferric reductase domain-containing protein protein transmembrane component domain-containing protein  31.4 
 
 		 410 aa  53.5  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3785  hypothetical protein  36.97 
 
 		 227 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0684997  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44460  hypothetical protein  36.97 
 
 		 227 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0430  hypothetical protein  29.41 
 
 		 95 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000570848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0311  hypothetical protein  31.82 
 
 		 145 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0239083  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0375  hypothetical protein  22.78 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.767045  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1382  protease  24.76 
 
 		 122 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0300  hypothetical protein  29.67 
 
 		 146 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0203  hypothetical protein  32.34 
 
 		 230 aa  50.8  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3817  plastocyanin domain-containing putative protein  25.29 
 
 		 116 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.657288  hitchhiker  0.00963655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3048  hypothetical protein  35.12 
 
 		 219 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2208  hypothetical protein  34.1 
 
 		 230 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224679  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4494  hypothetical protein  34.1 
 
 		 230 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1875  cupredoxin-like domain  25 
 
 		 95 aa  50.4  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000550089 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00396  putative secreted protein containing plastocyanin domain  34.15 
 
 		 111 aa  50.4  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0269  plastocyanin domain-containing protein  30 
 
 		 116 aa  49.7  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2163  hypothetical protein  33.53 
 
 		 230 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2213  hypothetical protein  33.53 
 
 		 230 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113796  normal  0.262784 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2221  hypothetical protein  34.48 
 
 		 235 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000192671  normal  0.249817 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4081  hypothetical protein  35.9 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1992  hypothetical protein  32.37 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0778906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0322  hypothetical protein  29.55 
 
 		 146 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.512657  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1229  hypothetical protein  33.93 
 
 		 219 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1952  hypothetical protein  31.79 
 
 		 230 aa  47  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2092  hypothetical protein  30.38 
 
 		 117 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0538  hypothetical protein  35.65 
 
 		 239 aa  46.2  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1262  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.71 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0282  hypothetical protein  31.28 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4261  hypothetical protein  28.28 
 
 		 144 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1290  hypothetical protein  37.61 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2418  hypothetical protein  33.14 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0165025  decreased coverage  0.000000160717 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02296  hypothetical protein  28.49 
 
 		 225 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1959  hypothetical protein  28.47 
 
 		 423 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178526  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19930  hypothetical protein  37.21 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1191  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  29.69 
 
 		 409 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2017  hypothetical protein  28.5 
 
 		 229 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1473  hypothetical protein  28.07 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.068517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0429  hypothetical protein  26.32 
 
 		 122 aa  43.5  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000714902  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00356  putative secreted protein containing plastocyanin domain  23.4 
 
 		 117 aa  43.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.700432  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2482  hypothetical protein  30.93 
 
 		 221 aa  43.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1814  hypothetical protein  33.94 
 
 		 227 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1874  cupredoxin-like domain  28.38 
 
 		 125 aa  42.7  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0499393  hitchhiker  0.00000000173475 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0252  hypothetical protein  33.68 
 
 		 223 aa  43.1  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1831  hypothetical protein  31.85 
 
 		 233 aa  42.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.177382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>