35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4378 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4378  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  346  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1995  hypothetical protein  50.29 
 
 
204 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1569  hypothetical protein  51.72 
 
 
153 aa  167  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.117351  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3497  hypothetical protein  38.58 
 
 
130 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3585  hypothetical protein  38.58 
 
 
130 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3654  hypothetical protein  38.58 
 
 
138 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 
928 aa  104  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4144  plastocyanin domain-containing protein  41.18 
 
 
119 aa  95.5  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9179  normal  0.258983 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2120  copper-translocating P-type ATPase  39.05 
 
 
918 aa  94  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.440139  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1382  protease  38.84 
 
 
122 aa  89  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00356  putative secreted protein containing plastocyanin domain  36.75 
 
 
117 aa  87.4  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.700432  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0269  plastocyanin domain-containing protein  31.09 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0429  hypothetical protein  31.15 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000714902  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3817  plastocyanin domain-containing putative protein  32.77 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.657288  hitchhiker  0.00963655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00396  putative secreted protein containing plastocyanin domain  37.17 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0213  plastocyanin domain-containing protein  31.09 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1874  cupredoxin-like domain  33.33 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0499393  hitchhiker  0.00000000173475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2092  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0125  hypothetical protein  38.46 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.933361  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0143  hypothetical protein  38.46 
 
 
115 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0132  hypothetical protein  38.46 
 
 
115 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0300  hypothetical protein  37.78 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  34.86 
 
 
902 aa  67.8  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0322  hypothetical protein  36.67 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.512657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0311  hypothetical protein  36.67 
 
 
145 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0239083  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  38.89 
 
 
621 aa  61.2  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0430  hypothetical protein  32.05 
 
 
95 aa  58.9  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000570848  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1875  cupredoxin-like domain  32.05 
 
 
95 aa  58.9  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000550089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5742  hypothetical protein  35.96 
 
 
311 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4261  hypothetical protein  35.63 
 
 
144 aa  54.7  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4417  hypothetical protein  36.62 
 
 
83 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  28.75 
 
 
499 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  33.98 
 
 
471 aa  48.1  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  27.91 
 
 
389 aa  48.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  30.99 
 
 
125 aa  42.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>