26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2092 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2092  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  244  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1382  protease  51.64 
 
 		 122 aa  136  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00356  putative secreted protein containing plastocyanin domain  50.43 
 
 		 117 aa  130  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.700432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0213  plastocyanin domain-containing protein  52.99 
 
 		 116 aa  127  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4144  plastocyanin domain-containing protein  47.32 
 
 		 119 aa  127  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9179  normal  0.258983 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0269  plastocyanin domain-containing protein  48.28 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3817  plastocyanin domain-containing putative protein  47.86 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.657288  hitchhiker  0.00963655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00396  putative secreted protein containing plastocyanin domain  46.3 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1995  hypothetical protein  38.6 
 
 		 204 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3585  hypothetical protein  29.57 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3654  hypothetical protein  29.57 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1569  hypothetical protein  36.04 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.117351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3497  hypothetical protein  31.03 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4378  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188877 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0429  hypothetical protein  32.76 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000714902  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  39.33 
 
 		 902 aa  67.4  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1874  cupredoxin-like domain  29.52 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0499393  hitchhiker  0.00000000173475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  27.93 
 
 		 928 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2120  copper-translocating P-type ATPase  31.43 
 
 		 918 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.440139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0430  hypothetical protein  27.47 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000570848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0125  hypothetical protein  27.85 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.933361  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0132  hypothetical protein  27.85 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0143  hypothetical protein  27.85 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5742  hypothetical protein  30.38 
 
 		 311 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1875  cupredoxin-like domain  28.24 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000550089 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0655  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>