28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0269 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0269  plastocyanin domain-containing protein  100 
 
 
116 aa  239  6e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0213  plastocyanin domain-containing protein  65.52 
 
 
116 aa  169  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3817  plastocyanin domain-containing putative protein  65.52 
 
 
116 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.657288  hitchhiker  0.00963655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00356  putative secreted protein containing plastocyanin domain  49.12 
 
 
117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.700432  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4144  plastocyanin domain-containing protein  48.7 
 
 
119 aa  130  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9179  normal  0.258983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1382  protease  50 
 
 
122 aa  127  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00396  putative secreted protein containing plastocyanin domain  51.43 
 
 
111 aa  121  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2092  hypothetical protein  48.28 
 
 
117 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1995  hypothetical protein  36.97 
 
 
204 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3585  hypothetical protein  31.97 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3654  hypothetical protein  31.97 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3497  hypothetical protein  32.79 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4378  hypothetical protein  31.73 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188877 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1569  hypothetical protein  32.14 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.117351  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0429  hypothetical protein  31.97 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000714902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1874  cupredoxin-like domain  30.77 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0499393  hitchhiker  0.00000000173475 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  37.63 
 
 
902 aa  66.6  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
928 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2120  copper-translocating P-type ATPase  36.59 
 
 
918 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.440139  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0125  hypothetical protein  29.03 
 
 
115 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.933361  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0132  hypothetical protein  27.96 
 
 
115 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0143  hypothetical protein  27.96 
 
 
115 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0300  hypothetical protein  28.92 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5742  hypothetical protein  29.73 
 
 
311 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0430  hypothetical protein  28 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000570848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0311  hypothetical protein  28.92 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0239083  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0322  hypothetical protein  27.71 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.512657  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1875  cupredoxin-like domain  26.67 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000550089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>