28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1875 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1875  cupredoxin-like domain  100 
 
 		 95 aa  192  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000550089 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0430  hypothetical protein  85.26 
 
 		 95 aa  172  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000570848  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1874  cupredoxin-like domain  52.13 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0499393  hitchhiker  0.00000000173475 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0429  hypothetical protein  48.94 
 
 		 122 aa  97.8  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000714902  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3654  hypothetical protein  32.56 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3585  hypothetical protein  32.56 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3497  hypothetical protein  31.4 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  34.74 
 
 		 902 aa  67.8  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2120  copper-translocating P-type ATPase  35.53 
 
 		 918 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.440139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1995  hypothetical protein  36.84 
 
 		 204 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0300  hypothetical protein  34.44 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0322  hypothetical protein  34.44 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.512657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0311  hypothetical protein  34.44 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0239083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4378  hypothetical protein  32.05 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  30.67 
 
 		 928 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4144  plastocyanin domain-containing protein  30.59 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9179  normal  0.258983 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0143  hypothetical protein  34.07 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0132  hypothetical protein  34.07 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1569  hypothetical protein  31.58 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.117351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0125  hypothetical protein  35.16 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.933361  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0213  plastocyanin domain-containing protein  30.21 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00356  putative secreted protein containing plastocyanin domain  32 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.700432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3817  plastocyanin domain-containing putative protein  33.33 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.657288  hitchhiker  0.00963655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5742  hypothetical protein  25 
 
 		 311 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1382  protease  26.47 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2092  hypothetical protein  28.24 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0269  plastocyanin domain-containing protein  26.67 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0655  hypothetical protein  27.27 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>