31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0430 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0430  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  195  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000570848  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1875  cupredoxin-like domain  85.26 
 
 
95 aa  172  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000550089 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1874  cupredoxin-like domain  53.19 
 
 
125 aa  107  7.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0499393  hitchhiker  0.00000000173475 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0429  hypothetical protein  50 
 
 
122 aa  103  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000714902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3585  hypothetical protein  37.93 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3654  hypothetical protein  37.93 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3497  hypothetical protein  37.21 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2120  copper-translocating P-type ATPase  34.21 
 
 
918 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.440139  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  36.84 
 
 
902 aa  63.5  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0311  hypothetical protein  35.56 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0239083  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1995  hypothetical protein  32.89 
 
 
204 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00356  putative secreted protein containing plastocyanin domain  35.56 
 
 
117 aa  61.6  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.700432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0300  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0322  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.512657  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4378  hypothetical protein  32.05 
 
 
170 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188877 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4144  plastocyanin domain-containing protein  31.76 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.9179  normal  0.258983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
928 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1569  hypothetical protein  32.89 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.117351  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0213  plastocyanin domain-containing protein  32 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0143  hypothetical protein  30.77 
 
 
115 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0125  hypothetical protein  31.87 
 
 
115 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.933361  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0132  hypothetical protein  30.77 
 
 
115 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5742  hypothetical protein  29.41 
 
 
311 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1382  protease  32 
 
 
122 aa  50.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3817  plastocyanin domain-containing putative protein  30.67 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.657288  hitchhiker  0.00963655 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0269  plastocyanin domain-containing protein  28 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2092  hypothetical protein  27.47 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0655  hypothetical protein  27.27 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4261  hypothetical protein  31.46 
 
 
144 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  29.03 
 
 
621 aa  41.2  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00396  putative secreted protein containing plastocyanin domain  21.88 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>