100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0962 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0962  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  481  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.915244  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1533  PASTA domain containing protein  52.08 
 
 
244 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0715242  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1104  PASTA domain containing protein  45.83 
 
 
244 aa  223  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0989  PASTA domain-containing protein  45.83 
 
 
244 aa  207  9e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1218  hypothetical protein  43.75 
 
 
244 aa  206  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.574754 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1187  PASTA domain containing protein  42.41 
 
 
251 aa  176  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000264979  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1452  PASTA domain containing protein  38.94 
 
 
244 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.228352  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1368  hypothetical protein  26.72 
 
 
298 aa  92.4  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0923  hypothetical protein  27.69 
 
 
258 aa  85.5  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0499839  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  28.76 
 
 
692 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0178  PASTA domain containing protein  31.16 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00052168  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.46 
 
 
652 aa  80.1  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0294  PASTA domain containing protein  26.02 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  29.3 
 
 
598 aa  72.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  31.43 
 
 
612 aa  72  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  30.43 
 
 
621 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  25.81 
 
 
612 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2045  PASTA domain containing protein  27.87 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  26.99 
 
 
672 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  27.83 
 
 
691 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.76 
 
 
645 aa  65.9  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  27.73 
 
 
651 aa  65.1  0.0000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.38 
 
 
627 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5945  PASTA domain containing protein  28.57 
 
 
273 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.637805  normal  0.0723251 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1665  PASTA domain containing protein  30.19 
 
 
367 aa  62.4  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000110071  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.18 
 
 
667 aa  61.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  26.12 
 
 
664 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  26.12 
 
 
664 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  27.18 
 
 
692 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  27.35 
 
 
646 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1846  PASTA domain containing protein  29.57 
 
 
254 aa  59.7  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0407237  normal  0.022075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2925  PASTA domain containing protein  25.75 
 
 
264 aa  58.9  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  31.95 
 
 
615 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  22.73 
 
 
638 aa  56.6  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1953  PASTA domain-containing protein  30.39 
 
 
560 aa  56.6  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.86563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27990  protein kinase family protein with PASTA domain protein  28.37 
 
 
658 aa  55.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.210084 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.43 
 
 
632 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  26.76 
 
 
668 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.97 
 
 
658 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.92 
 
 
681 aa  54.7  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  22.84 
 
 
666 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  29.63 
 
 
625 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  25.48 
 
 
656 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.69 
 
 
681 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  28.02 
 
 
623 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  32.35 
 
 
658 aa  52.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  30.3 
 
 
758 aa  52  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  25 
 
 
618 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.78 
 
 
681 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.8 
 
 
626 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.11 
 
 
676 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2230  PASTA domain-containing protein  26.64 
 
 
323 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.99 
 
 
707 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.21 
 
 
613 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  26.2 
 
 
691 aa  49.3  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.26 
 
 
662 aa  49.3  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  28.3 
 
 
642 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.77 
 
 
641 aa  48.9  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4230  PASTA domain-containing protein  27.13 
 
 
252 aa  48.5  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.64 
 
 
718 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581309  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.77 
 
 
607 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1203  PASTA domain containing protein  22.78 
 
 
290 aa  47.4  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0391  PASTA domain containing protein  32.69 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.57 
 
 
603 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3480  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.24 
 
 
660 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.939542  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.81 
 
 
594 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1196  PASTA  29.53 
 
 
584 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0733  PASTA domain-containing protein  35.34 
 
 
541 aa  46.6  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.8 
 
 
520 aa  45.8  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2619  PASTA domain-containing protein  29.2 
 
 
205 aa  45.4  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1643  PASTA domain-containing protein  23.01 
 
 
330 aa  44.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0689  kinase domain protein  24.2 
 
 
796 aa  45.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0554  PASTA domain containing protein  26.96 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0972959  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1569  PASTA domain-containing protein  25.78 
 
 
460 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.589734  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25 
 
 
715 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4788  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.48 
 
 
723 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  33.33 
 
 
609 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  25.3 
 
 
623 aa  44.3  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.61 
 
 
647 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.63 
 
 
613 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08001  hypothetical protein  24.51 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1639  PASTA domain containing protein  37.18 
 
 
501 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81867  hitchhiker  0.00180269 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22480  hypothetical protein  33.87 
 
 
335 aa  43.5  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.606654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1396  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.92 
 
 
843 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.46 
 
 
598 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  28.02 
 
 
736 aa  43.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  29.76 
 
 
719 aa  43.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  24.57 
 
 
625 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  33.87 
 
 
662 aa  43.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.54 
 
 
601 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3077  serine/threonine protein kinase  25.93 
 
 
708 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1835  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.07 
 
 
658 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.192402 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 
582 aa  42.7  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 
657 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.75 
 
 
650 aa  42.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.09 
 
 
657 aa  42.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.99 
 
 
647 aa  42.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  26.4 
 
 
625 aa  42.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0744  PASTA domain-containing protein  28.57 
 
 
334 aa  42  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.947966  hitchhiker  0.000000811386 
 
 
-
 
NC_002950  PG0731  hypothetical protein  27.83 
 
 
218 aa  42  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>