More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0814 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0814  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  336  9e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.565462  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  60.53 
 
 		 160 aa  191  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 		 160 aa  179  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1404  Endoribonuclease L-PSP  59.6 
 
 		 161 aa  168  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0960  hypothetical protein  55.26 
 
 		 162 aa  167  8e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.304597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1285  Endoribonuclease L-PSP  58.33 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1008  Endoribonuclease L-PSP  52.94 
 
 		 162 aa  157  7e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  48.08 
 
 		 157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  45.95 
 
 		 153 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  46.45 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  48.68 
 
 		 154 aa  127  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  47.68 
 
 		 153 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  41.45 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  48.7 
 
 		 156 aa  124  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  48.23 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  45.64 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  44.97 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  43.42 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  45.86 
 
 		 155 aa  114  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  40.82 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  42.95 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  41.98 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 		 152 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  44.3 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  45.03 
 
 		 151 aa  111  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  46.1 
 
 		 162 aa  110  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  39.49 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  42.86 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  39.49 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1999  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  43.17 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  43.17 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  43.17 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  49.19 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  43.14 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  38.82 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  48.78 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  47.41 
 
 		 153 aa  105  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2788  Endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 163 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  45.71 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 157 aa  104  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  44.06 
 
 		 152 aa  104  6e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  35.71 
 
 		 407 aa  104  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  43.42 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  48.3 
 
 		 152 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  38.82 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  39.87 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04880  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  48.59 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  36.17 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  41.98 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  39.35 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  38.82 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  38.31 
 
 		 152 aa  99  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 156 aa  98.6  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  37.34 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  36.84 
 
 		 152 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  43.54 
 
 		 155 aa  97.4  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 155 aa  97.8  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  35.71 
 
 		 409 aa  97.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  42.36 
 
 		 152 aa  97.8  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 155 aa  97.4  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5536  endoribonuclease L-PSP  38.51 
 
 		 156 aa  97.1  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.044824 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  43.15 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  38.78 
 
 		 155 aa  97.1  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 154 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  35.44 
 
 		 152 aa  96.3  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  38.36 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  40.13 
 
 		 153 aa  96.3  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 154 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  35.8 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  38.41 
 
 		 152 aa  95.1  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  34.39 
 
 		 157 aa  94.4  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  37.75 
 
 		 152 aa  94.4  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  37.75 
 
 		 152 aa  94.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  37.75 
 
 		 152 aa  94.4  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  37.75 
 
 		 152 aa  94.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  38.51 
 
 		 154 aa  94.4  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2951  Endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  37.09 
 
 		 152 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  37.09 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0607  Endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 155 aa  94  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  36.77 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  36.77 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  36.77 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7448  endoribonuclease L-PSP  36.3 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  36.77 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  34 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  36.77 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  36.77 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2665  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 158 aa  92.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119908  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>