More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3359 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  100 
 
 
255 aa  500  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5577  oxidoreductase FAD-binding subunit  64.2 
 
 
261 aa  301  8.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6290  oxidoreductase FAD-binding region  62.4 
 
 
250 aa  285  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2269  oxidoreductase FAD-binding subunit  61.81 
 
 
252 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3726  oxidoreductase FAD-binding region  58.61 
 
 
243 aa  276  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4092  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  57.79 
 
 
269 aa  268  5.9999999999999995e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3261  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  60.92 
 
 
244 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1054  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  53.44 
 
 
248 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.543826  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0922  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  47.72 
 
 
247 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1056  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  49.17 
 
 
264 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2080  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.83 
 
 
239 aa  171  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.7178  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2125  oxidoreductase FAD-binding subunit  45.68 
 
 
243 aa  168  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.122233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2402  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.68 
 
 
243 aa  168  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.560839  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0605  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  46.25 
 
 
242 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0121  oxidoreductase FAD-binding region  38.93 
 
 
248 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5181  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  46.5 
 
 
234 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350006  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0231  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  53.38 
 
 
168 aa  138  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.202422  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3398  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.98 
 
 
259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0109  oxidoreductase FAD-binding region  41.94 
 
 
216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4471  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.21 
 
 
233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2611  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.94 
 
 
198 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124004  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0935  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.36 
 
 
251 aa  120  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.33 
 
 
368 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.95 
 
 
687 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4465  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.45 
 
 
699 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211507  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03005  Phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.69 
 
 
349 aa  95.1  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5611  putative oxidoreductase  37.44 
 
 
355 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.71 
 
 
681 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  30.41 
 
 
605 aa  93.2  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.26 
 
 
687 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  28.86 
 
 
396 aa  92  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  31.46 
 
 
605 aa  91.3  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.18 
 
 
585 aa  90.5  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.82 
 
 
702 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2459  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.2 
 
 
352 aa  89  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109529  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  29.75 
 
 
393 aa  89  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0668  ferredoxin  35.71 
 
 
362 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0416627 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  27.73 
 
 
348 aa  88.2  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3715  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.96 
 
 
467 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437326  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.24 
 
 
700 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.88 
 
 
690 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.78 
 
 
342 aa  87  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  31.87 
 
 
676 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  33.33 
 
 
675 aa  86.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1034  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32.88 
 
 
323 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0971  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32.88 
 
 
323 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3091  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.35 
 
 
357 aa  85.9  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255521  hitchhiker  0.000372207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64620  putative oxidoreductase  35.53 
 
 
366 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407682  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00877  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  33.18 
 
 
322 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2770  ferredoxin  33.18 
 
 
322 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00883  hypothetical protein  33.18 
 
 
322 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2459  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  33.18 
 
 
322 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0945  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  33.18 
 
 
322 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968361  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2333  nitric oxide dioxygenase  31.28 
 
 
393 aa  85.5  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1053  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32.88 
 
 
323 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1003  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32.88 
 
 
323 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  30.26 
 
 
627 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3076  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.46 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.163455 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0976  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32.72 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32.57 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  32.67 
 
 
670 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  27.4 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1353  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.44 
 
 
848 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155715  normal  0.293689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  30 
 
 
678 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  27.65 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  29.64 
 
 
597 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  30.16 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0913  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer subunit BenC  30.67 
 
 
339 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6164  nitric oxide dioxygenase  29.38 
 
 
393 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  28.9 
 
 
394 aa  84  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0936  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32.88 
 
 
323 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0508  ferredoxin  30.7 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.303507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3622  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.12 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32.72 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.843947 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  31.09 
 
 
625 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3449  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.47 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0539765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.71 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  30.71 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.48 
 
 
402 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3514  conserved hypothetical protein; K05916 nitric oxide dioxygenase  30.49 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.88 
 
 
678 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  29.36 
 
 
402 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32.26 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  27.27 
 
 
373 aa  82.8  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0832  nitric oxide dioxygenase  32.08 
 
 
392 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56489  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  29.76 
 
 
402 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.4 
 
 
686 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.45 
 
 
376 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  29.76 
 
 
402 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2973  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.8 
 
 
341 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  25.9 
 
 
402 aa  82  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  26.94 
 
 
402 aa  82  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  26.94 
 
 
402 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  25.9 
 
 
402 aa  82  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  26.91 
 
 
402 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.77 
 
 
337 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  29.76 
 
 
399 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  26.94 
 
 
402 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  29.62 
 
 
402 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  28.69 
 
 
402 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>