55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2184 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 		 549 aa  1142    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2842  Rieske (2Fe-2S) domain protein  55.15 
 
 		 526 aa  595  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2206  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.34 
 
 		 516 aa  513  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0475184  normal  0.51009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1330  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.86 
 
 		 529 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.76 
 
 		 529 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5657  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.94 
 
 		 520 aa  463  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302322  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1152  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.99 
 
 		 521 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142651  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0156  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  46.1 
 
 		 525 aa  457  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0188  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  45.57 
 
 		 548 aa  457  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.99 
 
 		 516 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.363505  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5026  Rieske (2Fe-2S) region  44.99 
 
 		 516 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276564  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5407  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.8 
 
 		 516 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13852  hypothetical protein  45.42 
 
 		 516 aa  443  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1515  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.04 
 
 		 469 aa  95.1  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.61 
 
 		 481 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0163  hypothetical protein  26.61 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000295747 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1644  metallo-beta-lactamase family protein  25.41 
 
 		 530 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0135  polyketide synthase  25.41 
 
 		 530 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1563  metallo-beta-lactamase family protein  25.41 
 
 		 530 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.177034  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08671  hypothetical protein  22.55 
 
 		 479 aa  53.9  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0459434  unclonable  0.0000000643383 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1238  polyketide synthase  24.59 
 
 		 530 aa  52.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  49.15 
 
 		 126 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  36.56 
 
 		 599 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.66 
 
 		 326 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  34.85 
 
 		 114 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383279  normal  0.78464 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0162  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.9 
 
 		 98 aa  48.1  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2815  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.7 
 
 		 107 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  56.41 
 
 		 356 aa  47.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4524  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  31.82 
 
 		 112 aa  47  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1628  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  33.33 
 
 		 109 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199649  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  45.65 
 
 		 352 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  39.62 
 
 		 98 aa  46.2  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  36.25 
 
 		 452 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.85 
 
 		 99 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  43.48 
 
 		 289 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5192  hypothetical protein  25.7 
 
 		 541 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1335  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.15 
 
 		 116 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000656447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1307  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.15 
 
 		 116 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 122 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  38.16 
 
 		 376 aa  45.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6339  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.33 
 
 		 125 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.515952 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  35 
 
 		 452 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  55 
 
 		 431 aa  45.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  52.38 
 
 		 440 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  50 
 
 		 437 aa  44.7  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03728  hypothetical protein  31.45 
 
 		 537 aa  44.3  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.42275 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  45.65 
 
 		 315 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  42.5 
 
 		 103 aa  44.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5893  nitrite reductase small subunit  37.25 
 
 		 111 aa  44.3  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50 
 
 		 448 aa  44.3  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4335  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  34.21 
 
 		 118 aa  44.3  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2965  hypothetical protein  35.23 
 
 		 252 aa  43.9  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0145434  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0217  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  50 
 
 		 437 aa  43.9  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3441  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.69 
 
 		 599 aa  43.5  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2177  hypothetical protein  28.95 
 
 		 303 aa  43.5  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>