209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3992 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3992  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  445  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0311  hypothetical protein  46.12 
 
 		 197 aa  184  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3234  hypothetical protein  46.7 
 
 		 190 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0315  hypothetical protein  45.63 
 
 		 197 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.555967 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3039  hypothetical protein  43 
 
 		 189 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  34.02 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  34.72 
 
 		 233 aa  107  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  30.63 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  33.68 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  31.28 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  32.31 
 
 		 259 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  29.58 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  30.58 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  32.99 
 
 		 221 aa  98.2  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  29.66 
 
 		 261 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  32.69 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  32.38 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  31.14 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  27.6 
 
 		 252 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  30.58 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  31.82 
 
 		 266 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  31.82 
 
 		 266 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  30.69 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  29.9 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  26.79 
 
 		 268 aa  93.2  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  31.44 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  29.22 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  33.84 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  31.02 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  30.1 
 
 		 224 aa  92.4  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  27.85 
 
 		 268 aa  92  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  28.37 
 
 		 257 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  33.84 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  33.84 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  31.47 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  91.3  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  30.3 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  27.72 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  24.22 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  27.15 
 
 		 254 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  28.12 
 
 		 255 aa  89.4  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  28.71 
 
 		 261 aa  89  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  28.5 
 
 		 252 aa  89  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  30.81 
 
 		 239 aa  88.6  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  31.69 
 
 		 244 aa  88.2  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  27.59 
 
 		 227 aa  87.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  30.1 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  26.96 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  31.09 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  26.98 
 
 		 252 aa  86.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  27.15 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  27.36 
 
 		 240 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  32.06 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  28.3 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  29.11 
 
 		 226 aa  85.5  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  30.48 
 
 		 236 aa  85.1  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  30.61 
 
 		 226 aa  85.1  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  31.47 
 
 		 221 aa  84.7  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  27.93 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  29.5 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  31.61 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  28.49 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  28.96 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  29.9 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  27.14 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  28.12 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  25.78 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  36.22 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2115  protein of unknown function DUF159  28.35 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  29.02 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  25.26 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  29.52 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  29.15 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  31.63 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0715  hypothetical protein  25.64 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  30.09 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  26.09 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  34.72 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  28.72 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  25 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2706  hypothetical protein  27.14 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.973697  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1708  hypothetical protein  27.14 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12701  hypothetical protein  30.33 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2167  hypothetical protein  27.14 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1715  protein of unknown function DUF159  26.63 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.286255  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1250  hypothetical protein  27.14 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336895  normal  0.442169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  29.46 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  30.73 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  33.57 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  25.98 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1061  hypothetical protein  26.63 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000115986  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  23.83 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  27.84 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  26.2 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  29.27 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  25.98 
 
 		 254 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  26.76 
 
 		 253 aa  74.7  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  29.56 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  28.96 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  25.88 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>