More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0512 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0526  nitrite/sulfite reductase-like protein  93.99 
 
 
516 aa  970    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.574671  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0512  nitrite/sulfite reductase-like protein  100 
 
 
516 aa  1050    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  33.96 
 
 
796 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0485  Sulfite reductase (ferredoxin)  32.66 
 
 
490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1146  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.24 
 
 
697 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3092  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.93 
 
 
697 aa  193  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000117991  hitchhiker  0.00929399 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0679  sulfite reductase ferredoxin  26.75 
 
 
602 aa  189  7e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1504  sulfite reductase (ferredoxin)  26.89 
 
 
696 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361579  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5531  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.46 
 
 
609 aa  186  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.1 
 
 
757 aa  181  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  27.24 
 
 
542 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3268  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.65 
 
 
606 aa  170  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3346  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  25 
 
 
605 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2051  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.44 
 
 
720 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.773496 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  28.45 
 
 
541 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6617  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.05 
 
 
704 aa  166  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00459026 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3155  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  24.56 
 
 
606 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.126961  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  25.53 
 
 
586 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1401  sulfite reductase, hemoprotein subunit  26.27 
 
 
550 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0403368  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2637  sulfite reductase (NADPH)  26.79 
 
 
713 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  25.21 
 
 
567 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  27 
 
 
540 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  27 
 
 
540 aa  160  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  27.68 
 
 
551 aa  159  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  27 
 
 
540 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  27 
 
 
540 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  27 
 
 
540 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  27.06 
 
 
540 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  26.84 
 
 
540 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  27.29 
 
 
540 aa  159  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  26.84 
 
 
540 aa  158  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  26.87 
 
 
540 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4694  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  26.3 
 
 
551 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2618  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.65 
 
 
742 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4432  ferredoxin--nitrite reductase  26.35 
 
 
607 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  27.41 
 
 
540 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  26.94 
 
 
643 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.96 
 
 
793 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1101  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  26.61 
 
 
557 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.251663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1397  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  26.42 
 
 
551 aa  152  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  26.17 
 
 
560 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.13 
 
 
590 aa  150  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  26.59 
 
 
648 aa  150  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1381  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  26.77 
 
 
551 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.244986  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.77 
 
 
569 aa  150  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.9 
 
 
805 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3604  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  26.38 
 
 
614 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387306  normal  0.13043 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  26.78 
 
 
639 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3991  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  25.05 
 
 
556 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661802  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  28.69 
 
 
553 aa  146  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.04 
 
 
562 aa  146  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  28.89 
 
 
553 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4013  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.01 
 
 
550 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1638  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  24.49 
 
 
556 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123155  normal  0.260957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6980  sulfite/ferredoxin-nitrite reductase  26.85 
 
 
551 aa  144  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  26.41 
 
 
591 aa  143  7e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  26.51 
 
 
604 aa  143  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  25.25 
 
 
608 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1825  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.68 
 
 
556 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.291186  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  23.58 
 
 
553 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  25.79 
 
 
510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  26.39 
 
 
548 aa  141  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2912  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.81 
 
 
557 aa  141  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.198106 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  25.79 
 
 
513 aa  141  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2345  sulfite reductase (ferredoxin)  25.41 
 
 
553 aa  140  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0166972 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  25.83 
 
 
512 aa  140  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.94 
 
 
567 aa  139  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  26.33 
 
 
521 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.24 
 
 
591 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.96 
 
 
550 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2148  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  24.72 
 
 
557 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.249832  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1671  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.9 
 
 
558 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0706341  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  25.18 
 
 
633 aa  137  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  26.33 
 
 
542 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  24.85 
 
 
545 aa  137  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0798  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.15 
 
 
560 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  26.71 
 
 
516 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1110  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.67 
 
 
560 aa  136  8e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.21 
 
 
573 aa  136  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0190  sulfite reductase (ferredoxin)  24.63 
 
 
556 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.81 
 
 
565 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.99 
 
 
556 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  25.21 
 
 
581 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  23.11 
 
 
586 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1773  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  23.76 
 
 
553 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.155846  normal  0.725571 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  27.21 
 
 
513 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0181  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  25 
 
 
556 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  27.21 
 
 
513 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0889  sulfite reductase (ferredoxin)  24.43 
 
 
552 aa  134  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0812727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.37 
 
 
592 aa  134  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.26 
 
 
568 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0175  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  25 
 
 
556 aa  134  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.815169  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3124  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  23.37 
 
 
564 aa  133  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  26.84 
 
 
621 aa  133  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1264  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  24.9 
 
 
551 aa  133  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.657041  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1931  ferredoxin--nitrite reductase  24 
 
 
556 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  25.61 
 
 
586 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  24.95 
 
 
586 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.64 
 
 
569 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.23 
 
 
570 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>