44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1765 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  93.99 
 
 		 366 aa  689    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  726    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0232  hypothetical protein  33.43 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0635446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0974  hypothetical protein  26.53 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1066  hypothetical protein  26.08 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0843  hypothetical protein  26.53 
 
 		 396 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0888  hypothetical protein  26.53 
 
 		 396 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.112728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0791  hypothetical protein  26.53 
 
 		 396 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0976  hypothetical protein  26.28 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000233019 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0716  hypothetical protein  24.73 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  21.43 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  21.49 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3595  hypothetical protein  31.07 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000806669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  27.27 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  22.43 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5558  hypothetical protein  23.53 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  21.45 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  20 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3432  hypothetical protein  23.78 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4314  hypothetical protein  26 
 
 		 333 aa  57  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.44 
 
 		 461 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  21.77 
 
 		 517 aa  56.2  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  24.37 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4831  hypothetical protein  24 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.643352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4683  hypothetical protein  26.67 
 
 		 331 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  21.57 
 
 		 517 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  19.85 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  19.6 
 
 		 385 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  19.54 
 
 		 391 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  19.47 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1764  hypothetical protein  30.49 
 
 		 101 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4640  hypothetical protein  22.18 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.191606  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  22.08 
 
 		 308 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  20.22 
 
 		 391 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  20.93 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  21.39 
 
 		 391 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0831  hypothetical protein  20.42 
 
 		 297 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  21.9 
 
 		 316 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  20.33 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  24.55 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  21.11 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4242  hypothetical protein  22.89 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  20.23 
 
 		 391 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  31.15 
 
 		 349 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>