More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0305 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  100 
 
 		 521 aa  1042    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  96.16 
 
 		 521 aa  999    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.71 
 
 		 555 aa  296  6e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  34.4 
 
 		 557 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.36 
 
 		 554 aa  240  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.16 
 
 		 558 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  28.8 
 
 		 538 aa  201  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.1 
 
 		 536 aa  196  8.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.1 
 
 		 536 aa  196  8.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.8 
 
 		 438 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  35.27 
 
 		 595 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  35.27 
 
 		 595 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  33.95 
 
 		 596 aa  140  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2064  mismatch repair ATPase  28.84 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.46 
 
 		 607 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  31.89 
 
 		 601 aa  126  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.27 
 
 		 605 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.15 
 
 		 624 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.29 
 
 		 598 aa  123  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  24.57 
 
 		 593 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  23.28 
 
 		 626 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.58 
 
 		 610 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.12 
 
 		 618 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.64 
 
 		 590 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  32.61 
 
 		 793 aa  111  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.7 
 
 		 586 aa  111  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  30.4 
 
 		 601 aa  110  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  30.66 
 
 		 868 aa  109  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  30.37 
 
 		 590 aa  109  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  32.25 
 
 		 793 aa  108  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.56 
 
 		 450 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  29.15 
 
 		 884 aa  106  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  29.15 
 
 		 884 aa  106  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  27.14 
 
 		 853 aa  106  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.49 
 
 		 615 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  29.27 
 
 		 863 aa  105  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0174  DNA mismatch repair protein MutS  28.14 
 
 		 820 aa  104  3e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  28.94 
 
 		 860 aa  104  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  28.37 
 
 		 858 aa  103  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  27.84 
 
 		 903 aa  103  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  26.26 
 
 		 1088 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  26.62 
 
 		 1085 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  29.67 
 
 		 819 aa  102  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  31.75 
 
 		 817 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  26.5 
 
 		 862 aa  101  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4552  DNA mismatch repair protein MutS  25.54 
 
 		 871 aa  101  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  23.7 
 
 		 917 aa  100  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  27.02 
 
 		 853 aa  99.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  26.69 
 
 		 854 aa  99.8  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  25.64 
 
 		 856 aa  99  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.37 
 
 		 597 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3224  DNA mismatch repair protein MutS  27.78 
 
 		 895 aa  98.6  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.58 
 
 		 610 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  25.53 
 
 		 875 aa  98.6  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.37 
 
 		 597 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2284  DNA mismatch repair protein MutS  29.61 
 
 		 897 aa  99  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.339354  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  25.46 
 
 		 893 aa  99  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  29.91 
 
 		 932 aa  99  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  26.67 
 
 		 870 aa  98.2  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  32.89 
 
 		 823 aa  98.2  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  25.59 
 
 		 956 aa  98.6  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  30.29 
 
 		 886 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  26.43 
 
 		 853 aa  98.2  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  28.37 
 
 		 852 aa  97.8  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.87 
 
 		 604 aa  97.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  26.15 
 
 		 853 aa  97.4  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  27.66 
 
 		 855 aa  97.1  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  26.43 
 
 		 853 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  29.37 
 
 		 848 aa  97.1  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  26.43 
 
 		 853 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  26.43 
 
 		 853 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  26.43 
 
 		 853 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  26.43 
 
 		 860 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  26.43 
 
 		 853 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  26.43 
 
 		 853 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  27.41 
 
 		 896 aa  96.7  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  26.43 
 
 		 853 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  26.33 
 
 		 889 aa  96.7  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  26.86 
 
 		 856 aa  96.7  9e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  29.2 
 
 		 848 aa  96.7  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0119  DNA mismatch repair protein MutS  26.94 
 
 		 931 aa  96.3  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.893903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  28.51 
 
 		 854 aa  95.9  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  28.78 
 
 		 872 aa  95.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1031  DNA mismatch repair protein MutS  28.24 
 
 		 851 aa  95.1  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  26.6 
 
 		 857 aa  95.1  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01479  DNA-binding protein of the mitochondria (Eurofung)  26.22 
 
 		 924 aa  95.1  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  30.71 
 
 		 858 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  25.81 
 
 		 850 aa  95.1  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  30.26 
 
 		 864 aa  95.1  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  25.98 
 
 		 902 aa  95.1  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  29.33 
 
 		 828 aa  95.1  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  27.46 
 
 		 865 aa  95.1  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  27.27 
 
 		 968 aa  95.1  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  25 
 
 		 846 aa  94.7  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  27.47 
 
 		 860 aa  94.4  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  26.07 
 
 		 856 aa  94.7  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  27.08 
 
 		 863 aa  94.4  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  28.47 
 
 		 881 aa  94.7  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  27.54 
 
 		 873 aa  94.4  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  25 
 
 		 846 aa  94  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>