38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00440 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM00440  ADP-ribosylation-like factor, putative  100 
 
 
195 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  51.2 
 
 
184 aa  175  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51819  predicted protein  50.88 
 
 
187 aa  175  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  42.51 
 
 
184 aa  130  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8244  predicted protein  41.51 
 
 
175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222929  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51064  predicted protein  40.24 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000653634  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69050  predicted protein  40.62 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.121793 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05912  ADP ribosylation factor A (Eurofung)  40.99 
 
 
182 aa  123  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03220  ARF small monomeric GTPase, putative  40.76 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79956  predicted protein  41.4 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.803161 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62979  predicted protein  41.4 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233166  normal  0.128067 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  40.25 
 
 
183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43251  predicted protein  39.16 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8255  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05020  ADP ribosylation factor (Eurofung)  38.04 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37806  predicted protein  38.85 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163906  normal  0.029284 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06630  put. CPS1 protein, putative  38.27 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.306978  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04290  small monomeric GTPase, putative  37.04 
 
 
186 aa  111  7.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56002  predicted protein  35.44 
 
 
162 aa  104  6e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254308  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03960  ADP-ribosylation factor, putative  35.67 
 
 
182 aa  99.8  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710992  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56609  predicted protein  35.85 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158476  normal  0.886863 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  31.87 
 
 
186 aa  85.9  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  31.87 
 
 
186 aa  85.9  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.348621 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  30.86 
 
 
179 aa  84.7  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13157  predicted protein  29.63 
 
 
177 aa  84.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  30.25 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03430  SAR small monomeric GTPase, putative  30.59 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000269904  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54420  predicted protein  32.14 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877951  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52766  putative ADP-ribosylation factor in the carboxypeptidase Y pathway  26.7 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167275  normal  0.735667 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00411  Small COPII coat GTPase sar1 (EC 3.6.5.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGB9]  27.65 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.395555  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02300  arf-related protein (arp), putative  34.58 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.241389  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67516  GTP-binding protein  26.9 
 
 
190 aa  62  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43732  predicted protein  25.27 
 
 
193 aa  61.2  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105149  normal  0.152758 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29284  predicted protein  27.87 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00634  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16970)  36.51 
 
 
276 aa  48.5  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00256949  normal  0.850865 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02285  hypothetical protein  25.58 
 
 
161 aa  45.4  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36721  predicted protein  29.49 
 
 
323 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  24.29 
 
 
203 aa  42  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  22.86 
 
 
208 aa  42  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.203181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>