More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ00520 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001303  ANIA_04315  ABC transporter, putative (Eurofung)  50.74 
 
 
751 aa  762    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.21831 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00520  regulation of translational elongation-related protein, putative  100 
 
 
732 aa  1510    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68683  ATP-binding cassette (ABC) family, regulator of translational elongation  48.31 
 
 
752 aa  712    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.525981  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12095  frustulin 5  40.73 
 
 
521 aa  446  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10367  predicted protein  42.59 
 
 
527 aa  435  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  39.96 
 
 
645 aa  411  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43066  predicted protein  38.97 
 
 
631 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.287268 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_51174  predicted protein  40.99 
 
 
623 aa  405  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89200  predicted protein  39.19 
 
 
685 aa  402  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.564175 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  37.89 
 
 
615 aa  402  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  38.12 
 
 
642 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  37.52 
 
 
633 aa  402  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  38.03 
 
 
625 aa  396  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  37.57 
 
 
615 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41659  predicted protein  35.85 
 
 
645 aa  396  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.666462  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12543  predicted protein  38.02 
 
 
557 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0560437  normal  0.0167575 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  38.03 
 
 
625 aa  399  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  37.57 
 
 
615 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14998  predicted protein  40.62 
 
 
582 aa  391  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1820  ABC transporter related  38.12 
 
 
615 aa  392  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273612  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3467  ABC transporter related  37.36 
 
 
625 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00300  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  38.3 
 
 
625 aa  387  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681189  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  39.56 
 
 
633 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69340  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.11 
 
 
638 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02210  ABC transporter (Eurofung)  38.57 
 
 
610 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177403  normal  0.0978549 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  39.77 
 
 
635 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  37.98 
 
 
641 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5997  ABC transporter ATP-binding protein  39.56 
 
 
638 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148625  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0217  ABC transporter related  39.45 
 
 
636 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631932  normal  0.82416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0196  ABC transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 
636 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466605  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89162  ABC transporter  37.57 
 
 
609 aa  381  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.49 
 
 
637 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  39.82 
 
 
636 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  39.23 
 
 
633 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  38.15 
 
 
648 aa  382  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  39.78 
 
 
651 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0886  ABC transporter related  39.77 
 
 
637 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  40.15 
 
 
636 aa  379  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.66 
 
 
635 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  37.57 
 
 
638 aa  378  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  39.77 
 
 
636 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2317  ABC transporter related  37.66 
 
 
627 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359814  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  39.96 
 
 
637 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0289  ABC transporter related  38.92 
 
 
636 aa  378  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.66 
 
 
635 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.66 
 
 
635 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.66 
 
 
635 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  39.96 
 
 
637 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  39.96 
 
 
637 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  37.75 
 
 
637 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  37.75 
 
 
637 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.66 
 
 
635 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.4 
 
 
639 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.75 
 
 
637 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.75 
 
 
637 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  37.66 
 
 
637 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  38.94 
 
 
636 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.77 
 
 
637 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  36.31 
 
 
636 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.78 
 
 
635 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  36.75 
 
 
627 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.78 
 
 
635 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.75 
 
 
637 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.75 
 
 
637 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  39.59 
 
 
637 aa  376  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  39.59 
 
 
637 aa  376  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  39.67 
 
 
672 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  39.33 
 
 
636 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.75 
 
 
637 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  37.75 
 
 
637 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  39.59 
 
 
637 aa  375  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0048  ABC transporter related  38.76 
 
 
664 aa  374  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  35.06 
 
 
627 aa  372  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 
637 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0972  ABC transporter related  37.91 
 
 
626 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  35.95 
 
 
627 aa  372  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  38.84 
 
 
636 aa  372  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  36.56 
 
 
627 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  38.27 
 
 
659 aa  372  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1349  ABC transporter related  36.78 
 
 
618 aa  372  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2484  ABC transporter related  37.23 
 
 
625 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.814906  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  37.23 
 
 
636 aa  372  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  38.45 
 
 
639 aa  371  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2962  ABC transporter related  37.25 
 
 
619 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0574525  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2428  ABC transporter related  38.46 
 
 
625 aa  372  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3197  ABC transporter ATP-binding protein  38.11 
 
 
638 aa  372  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.79023  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  36.66 
 
 
629 aa  372  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  38.24 
 
 
624 aa  366  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  38.09 
 
 
657 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0037  ABC transporter ATPase  36.25 
 
 
672 aa  366  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.489009  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1348  ABC transporter related  37.41 
 
 
625 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0220  ABC transporter related  39.43 
 
 
615 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1310  ABC transporter related  38.84 
 
 
622 aa  369  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142081  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  37.32 
 
 
642 aa  365  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.22 
 
 
640 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0298  ABC transporter ATP-binding protein  38.55 
 
 
643 aa  365  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.75 
 
 
634 aa  364  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.85 
 
 
640 aa  363  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0045  ABC transporter related  36.07 
 
 
663 aa  363  4e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.919141  normal  0.873152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.85 
 
 
640 aa  363  4e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>