More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF00070 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF00070  glutamate-tRNA ligase, putative  100 
 
 		 728 aa  1501    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89978  glutamine-tRNA ligase  45.53 
 
 		 720 aa  550  1e-155  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.220095 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08224  glutamyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G03560)  45.35 
 
 		 680 aa  520  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39738  predicted protein  43.38 
 
 		 749 aa  483  1e-135  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51430  glutamate-trna ligase  45.97 
 
 		 523 aa  439  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 		 568 aa  272  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 		 555 aa  269  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 554 aa  268  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 554 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 554 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  33.14 
 
 		 554 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 554 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 554 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 554 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 554 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 554 aa  267  5e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 		 555 aa  266  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 		 552 aa  266  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 		 556 aa  266  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 		 559 aa  265  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  33.21 
 
 		 580 aa  265  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 		 555 aa  265  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 		 555 aa  265  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 		 555 aa  265  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 		 555 aa  265  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  31.98 
 
 		 552 aa  263  6.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2615  glutaminyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 		 556 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0694  glutaminyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 		 579 aa  262  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.450969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2413  glutaminyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 		 556 aa  262  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000218793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 		 552 aa  263  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 555 aa  262  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3486  glutaminyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 565 aa  262  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 		 552 aa  261  3e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 		 555 aa  261  4e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 		 555 aa  261  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  31.63 
 
 		 548 aa  261  4e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 555 aa  261  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 		 556 aa  259  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 		 552 aa  259  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 		 554 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 		 561 aa  258  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0094  glutaminyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 556 aa  257  4e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0665  glutaminyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 		 579 aa  257  5e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0340381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1533  glutaminyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 556 aa  257  5e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.208966  normal  0.486812 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  30.95 
 
 		 557 aa  257  6e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  32.7 
 
 		 556 aa  257  6e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 		 569 aa  257  6e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 		 556 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 552 aa  254  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 		 552 aa  254  3e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 		 556 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3294  glutaminyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 		 565 aa  253  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000133432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  33.21 
 
 		 553 aa  253  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03410  glutaminyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 		 555 aa  253  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 		 587 aa  253  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 580 aa  251  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1350  glutaminyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 		 777 aa  251  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0295693  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 582 aa  251  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 		 565 aa  251  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 		 560 aa  250  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 		 558 aa  250  7e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1249  glutaminyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 		 777 aa  250  8e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 565 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 		 570 aa  249  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 572 aa  249  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0814  glutaminyl-tRNA synthetase  30.17 
 
 		 597 aa  248  3e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000834243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4882  glutaminyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 540 aa  248  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2363  glutaminyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 		 570 aa  248  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.621285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 		 609 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 		 568 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 558 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2599  glutaminyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 		 778 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0790772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1263  glutaminyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 		 781 aa  246  9e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.578242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  33.08 
 
 		 562 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6655  glutaminyl-tRNA synthetase  31.6 
 
 		 583 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 557 aa  244  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 		 566 aa  245  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0737  glutaminyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 		 576 aa  244  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1619  glutaminyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 		 556 aa  244  6e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 		 554 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 		 556 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00615688  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 559 aa  243  9e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 		 555 aa  243  9e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 		 564 aa  243  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0807  glutaminyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 		 576 aa  243  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 		 561 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1585  glutaminyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 		 571 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000343871  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2758  glutaminyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 		 556 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112039  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2689  glutaminyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 		 556 aa  242  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00133273  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 		 576 aa  242  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 564 aa  242  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 551 aa  241  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  32.57 
 
 		 556 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 565 aa  240  5.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 556 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1269  glutaminyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 		 551 aa  240  8e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 		 561 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0694  glutaminyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 580 aa  239  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.352024  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0613  glutaminyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 587 aa  239  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.794454  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 		 563 aa  239  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>