More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0814 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 555 aa  669    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  56.75 
 
 		 567 aa  679    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  58.05 
 
 		 569 aa  677    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  57.88 
 
 		 564 aa  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0694  glutaminyl-tRNA synthetase  81.37 
 
 		 579 aa  1015    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.450969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 		 567 aa  682    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  56.75 
 
 		 567 aa  679    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  53.52 
 
 		 552 aa  634    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  55.38 
 
 		 559 aa  638    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  57.88 
 
 		 566 aa  671    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 556 aa  635    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0665  glutaminyl-tRNA synthetase  81.55 
 
 		 579 aa  1019    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0340381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  57.26 
 
 		 567 aa  676    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 555 aa  669    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 556 aa  638    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  56.67 
 
 		 548 aa  657    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  55.03 
 
 		 552 aa  638    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0814  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 597 aa  1251    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000834243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  56.91 
 
 		 556 aa  659    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 		 561 aa  660    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  54.71 
 
 		 556 aa  633  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 		 576 aa  629  1e-179  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 554 aa  622  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 554 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 554 aa  622  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 554 aa  622  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 554 aa  622  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 555 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 554 aa  624  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 555 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 555 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 554 aa  622  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 		 556 aa  623  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 555 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  53.26 
 
 		 554 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 555 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 555 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 554 aa  623  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 587 aa  618  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 554 aa  621  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 580 aa  621  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 558 aa  619  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1619  glutaminyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 556 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 		 555 aa  617  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 568 aa  615  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1585  glutaminyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 		 571 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000343871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 		 557 aa  615  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 		 565 aa  617  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 552 aa  618  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1482  glutaminyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 556 aa  615  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2758  glutaminyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 		 556 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112039  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2615  glutaminyl-tRNA synthetase  53.68 
 
 		 556 aa  615  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 		 556 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00615688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 554 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  53.43 
 
 		 561 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 572 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 590 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2413  glutaminyl-tRNA synthetase  53.68 
 
 		 556 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000218793  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 552 aa  612  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 		 556 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 		 556 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 		 560 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 556 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 552 aa  614  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1786  glutaminyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 		 556 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 569 aa  611  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  54.16 
 
 		 561 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 555 aa  610  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 562 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 563 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6655  glutaminyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 		 583 aa  604  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 		 564 aa  602  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1533  glutaminyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 556 aa  600  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.208966  normal  0.486812 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0492  glutaminyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 553 aa  600  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.607402 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 		 568 aa  599  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 559 aa  599  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 556 aa  598  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 		 565 aa  600  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 561 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2689  glutaminyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 		 556 aa  601  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00133273  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0421  glutaminyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 559 aa  598  1e-169  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3240  glutaminyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 556 aa  597  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00746606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 565 aa  597  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 555 aa  595  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 609 aa  594  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  53 
 
 		 563 aa  592  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  53.81 
 
 		 559 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 558 aa  594  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 		 570 aa  592  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 557 aa  588  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 558 aa  588  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 553 aa  589  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4882  glutaminyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 540 aa  589  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 589 aa  590  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 		 551 aa  586  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 		 565 aa  585  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 582 aa  585  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 559 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>