More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0694 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04610  glutaminyl-tRNA synthetase  79.1 
 
 		 579 aa  976    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.959469  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  56.84 
 
 		 567 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  56.13 
 
 		 555 aa  650    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 		 569 aa  634    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 		 564 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  55.54 
 
 		 553 aa  644    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 		 565 aa  646    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  56.84 
 
 		 567 aa  647    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0694  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 580 aa  1207    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.352024  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 567 aa  649    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 576 aa  639    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  56.31 
 
 		 567 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  57.24 
 
 		 556 aa  655    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0613  glutaminyl-tRNA synthetase  99.14 
 
 		 587 aa  1202    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.794454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  55.09 
 
 		 556 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  76.64 
 
 		 582 aa  926    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 561 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 		 554 aa  633  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 566 aa  634  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 568 aa  633  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  56.08 
 
 		 562 aa  630  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  54.32 
 
 		 555 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  54.06 
 
 		 568 aa  631  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6655  glutaminyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 583 aa  629  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 565 aa  628  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 		 569 aa  630  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 552 aa  625  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 		 565 aa  628  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 		 587 aa  625  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  55.87 
 
 		 565 aa  627  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 		 554 aa  622  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 		 554 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 		 554 aa  622  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 		 555 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  54.18 
 
 		 554 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 		 555 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 		 554 aa  622  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 556 aa  622  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 		 555 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 554 aa  622  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 556 aa  624  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 		 554 aa  622  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2363  glutaminyl-tRNA synthetase  55.26 
 
 		 570 aa  622  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.621285 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 		 555 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 		 580 aa  622  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 554 aa  619  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 554 aa  620  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 554 aa  620  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 555 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 552 aa  619  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  53.15 
 
 		 552 aa  619  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 552 aa  620  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 		 572 aa  616  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 555 aa  617  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 565 aa  613  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 558 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 556 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 560 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 		 565 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1220  glutaminyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 		 573 aa  608  1e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 		 569 aa  609  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 		 561 aa  611  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 569 aa  611  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 		 589 aa  609  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 		 569 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 564 aa  610  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 555 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 		 569 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 555 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 		 561 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 555 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 		 561 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  51.77 
 
 		 582 aa  605  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 563 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 609 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 570 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  54.32 
 
 		 559 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  53.79 
 
 		 558 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 		 569 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 552 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 552 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3475  glutaminyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 580 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675011  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 		 569 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0492  glutaminyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 553 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.607402 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 		 559 aa  598  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 569 aa  598  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 		 569 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 573 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0923  glutaminyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 		 569 aa  601  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 557 aa  600  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 580 aa  596  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 552 aa  595  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 569 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 569 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 596 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2082  glutaminyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 		 596 aa  597  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 569 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 569 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 569 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 569 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>