50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC02120 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC02120  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 895 aa  1855    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06053  mechanosensitive ion channel, putative (Eurofung)  31.99 
 
 		 943 aa  324  5e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07571  mechanosensitive ion channel, putative (Eurofung)  34.65 
 
 		 944 aa  322  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.659359  normal  0.533203 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50457  predicted protein  20.33 
 
 		 1065 aa  67.8  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0351497  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45222  predicted protein  20.45 
 
 		 1276 aa  58.2  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0393283  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 362 aa  57.4  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45221  predicted protein  19.83 
 
 		 1064 aa  54.3  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  24 
 
 		 389 aa  52.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  26.56 
 
 		 531 aa  49.7  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  29.06 
 
 		 286 aa  50.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  29.06 
 
 		 286 aa  50.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  29.06 
 
 		 286 aa  50.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  28.21 
 
 		 286 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  29.06 
 
 		 286 aa  50.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  26.58 
 
 		 286 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  26.58 
 
 		 286 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  26.58 
 
 		 291 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  26.58 
 
 		 286 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  26.58 
 
 		 286 aa  49.3  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  25.83 
 
 		 334 aa  49.3  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  26.58 
 
 		 286 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  26.58 
 
 		 286 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  26.58 
 
 		 286 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  26.16 
 
 		 284 aa  49.3  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  26.58 
 
 		 286 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20120  Mechanosensitive ion channel family protein  22.54 
 
 		 418 aa  47  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  25.76 
 
 		 374 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  23.02 
 
 		 400 aa  47.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  30.66 
 
 		 279 aa  47  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 200 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  25.36 
 
 		 561 aa  46.6  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  26.92 
 
 		 307 aa  46.6  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  25.38 
 
 		 375 aa  46.6  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  23.08 
 
 		 279 aa  47  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 540 aa  47  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  23.57 
 
 		 494 aa  46.6  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 549 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  21.48 
 
 		 298 aa  46.2  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 549 aa  46.2  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  25.76 
 
 		 374 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  25.76 
 
 		 374 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 261 aa  45.8  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1245  ion channel protein  22.61 
 
 		 261 aa  45.8  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 549 aa  45.8  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1966  hypothetical protein  23.29 
 
 		 268 aa  45.8  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4007  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 376 aa  45.4  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0987654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  20.45 
 
 		 408 aa  45.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  27.01 
 
 		 550 aa  44.7  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  25.71 
 
 		 533 aa  44.7  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2128  MscS mechanosensitive ion channel  22.12 
 
 		 270 aa  44.7  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>