29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45222 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45222  predicted protein  100 
 
 		 1276 aa  2610    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0393283  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45221  predicted protein  41.69 
 
 		 1064 aa  744    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50457  predicted protein  55.56 
 
 		 1065 aa  452  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0351497  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39605  predicted protein  32.66 
 
 		 1062 aa  365  2e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.608294  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44310  predicted protein  28.5 
 
 		 974 aa  306  1.0000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45225  predicted protein  27.05 
 
 		 1137 aa  164  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  25.67 
 
 		 341 aa  57.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 334 aa  57.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07571  mechanosensitive ion channel, putative (Eurofung)  18.14 
 
 		 944 aa  55.8  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.659359  normal  0.533203 
 
 
-
 
NC_002950  PG1966  hypothetical protein  31.4 
 
 		 268 aa  53.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  29.9 
 
 		 540 aa  49.3  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 547 aa  48.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 373 aa  48.5  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  25.9 
 
 		 277 aa  48.5  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  31.25 
 
 		 275 aa  47.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 393 aa  47  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  37.31 
 
 		 544 aa  45.8  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  29.91 
 
 		 366 aa  45.8  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1245  ion channel protein  23.23 
 
 		 261 aa  45.8  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  24.58 
 
 		 302 aa  45.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 362 aa  45.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02120  conserved hypothetical protein  20.45 
 
 		 895 aa  45.1  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  31.96 
 
 		 549 aa  45.1  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  31.96 
 
 		 549 aa  45.1  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  31.07 
 
 		 378 aa  44.7  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06053  mechanosensitive ion channel, putative (Eurofung)  20.45 
 
 		 943 aa  45.1  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  31.07 
 
 		 378 aa  45.1  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  31.96 
 
 		 549 aa  45.1  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  35.82 
 
 		 550 aa  44.7  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>