15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45221 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45221  predicted protein  100 
 
 
1064 aa  2182    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45222  predicted protein  42.27 
 
 
1276 aa  745    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0393283  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50457  predicted protein  52.76 
 
 
1065 aa  434  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0351497  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39605  predicted protein  37.84 
 
 
1062 aa  411  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.608294  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44310  predicted protein  32.46 
 
 
974 aa  339  1.9999999999999998e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45225  predicted protein  27.99 
 
 
1137 aa  182  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07571  mechanosensitive ion channel, putative (Eurofung)  19.12 
 
 
944 aa  58.9  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.659359  normal  0.533203 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1464  MscS Mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 
338 aa  54.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06053  mechanosensitive ion channel, putative (Eurofung)  23.5 
 
 
943 aa  53.5  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02120  conserved hypothetical protein  19.42 
 
 
895 aa  48.5  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  28.89 
 
 
773 aa  46.6  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  29.77 
 
 
327 aa  46.6  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  33.04 
 
 
298 aa  46.2  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  27.07 
 
 
813 aa  45.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  31.86 
 
 
378 aa  44.7  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>