17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44310 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44310  predicted protein  100 
 
 		 974 aa  2004    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39605  predicted protein  38.34 
 
 		 1062 aa  613  9.999999999999999e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.608294  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45221  predicted protein  32.61 
 
 		 1064 aa  349  2e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45222  predicted protein  28.64 
 
 		 1276 aa  313  6.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0393283  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50457  predicted protein  36.34 
 
 		 1065 aa  247  6e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0351497  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45225  predicted protein  23.54 
 
 		 1137 aa  86.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06053  mechanosensitive ion channel, putative (Eurofung)  20.59 
 
 		 943 aa  53.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29320  MscS family transporter: small-conductance mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 411 aa  52.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161796  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07571  mechanosensitive ion channel, putative (Eurofung)  21.5 
 
 		 944 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.659359  normal  0.533203 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  24.54 
 
 		 273 aa  50.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  31.67 
 
 		 274 aa  47.8  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  27.49 
 
 		 270 aa  45.8  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  31.11 
 
 		 275 aa  45.8  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0104  hypothetical protein  24.23 
 
 		 280 aa  45.4  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0511133  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  25.13 
 
 		 276 aa  45.1  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  25.15 
 
 		 286 aa  45.1  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1730  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 276 aa  44.7  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.351236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>