More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1595 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1595  DNA-binding response regulator, putative  100 
 
 		 295 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1780  DNA-binding response regulator, putative  98.64 
 
 		 295 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.756985  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1962  DNA-binding response regulator, putative  98.98 
 
 		 295 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0244  conserved hypothetical protein, putative two-component response regulator  59.66 
 
 		 291 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0408  response regulator receiver domain-containing protein  52.19 
 
 		 296 aa  281  9e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1488  response regulator receiver domain-containing protein  49.16 
 
 		 299 aa  275  9e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.47127  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1708  response regulator receiver  49.49 
 
 		 295 aa  272  5.000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0201  cation-efflux system membrane protein  46.46 
 
 		 296 aa  271  7e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1466  putative integral membrane protein  48.48 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2215  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  31.58 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  29.8 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0670  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3375  two-component response regulator CbrB  40.38 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0307811  normal  0.146362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3062  two-component response regulator CbrB  37.29 
 
 		 463 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  28.07 
 
 		 228 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1792  DNA-binding response regulator  34.78 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.37 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00581699  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2149  two component transcriptional regulator  31.86 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62540  two-component response regulator CbrB  37.04 
 
 		 478 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5443  two-component response regulator CbrB  37.04 
 
 		 477 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4013  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 467 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0316661  normal  0.37664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4696  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.56 
 
 		 480 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511164  decreased coverage  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0465  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.04 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4117  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 465 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.167574 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2101  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 228 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42680  sigma54-dependent response regulator, CbrB  36.54 
 
 		 466 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3589  two-component response regulator CbrB  36.54 
 
 		 477 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3016  two component transcriptional regulator  28.32 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2388  heavy metal response regulator  28.57 
 
 		 228 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000142984  normal  0.119734 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4405  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 448 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.851623  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4561  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 480 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.601271  hitchhiker  0.000975449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4695  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 480 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4808  two-component response regulator CbrB  34.62 
 
 		 478 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.069592  hitchhiker  0.0095877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0737  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 479 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000126889 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BasS  29.57 
 
 		 222 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3879  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.57 
 
 		 222 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  26.87 
 
 		 349 aa  53.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4547  DNA-binding transcriptional regulator BasR  28.7 
 
 		 222 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3914  DNA-binding transcriptional regulator BasR  29.57 
 
 		 222 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.730701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4578  DNA-binding transcriptional regulator BasR  29.57 
 
 		 222 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.800667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  28.7 
 
 		 222 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4353  DNA-binding transcriptional regulator BasR  29.57 
 
 		 222 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  28.7 
 
 		 222 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4687  DNA-binding transcriptional regulator BasR  28.7 
 
 		 222 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.20519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4667  DNA-binding transcriptional regulator BasR  29.57 
 
 		 222 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03945  hypothetical protein  29.57 
 
 		 222 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5626  DNA-binding transcriptional regulator BasR  29.57 
 
 		 222 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4554  DNA-binding transcriptional regulator BasR  28.7 
 
 		 222 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.57 
 
 		 226 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0964  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  34.62 
 
 		 478 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0831  response regulator receiver:sigma-54 factor, interaction region  34.62 
 
 		 494 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  29.57 
 
 		 222 aa  53.5  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1254  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 472 aa  53.1  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.388952 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.57 
 
 		 226 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.57 
 
 		 226 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4521  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.7 
 
 		 223 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0006  DNA-binding response regulator  32.74 
 
 		 225 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  29.57 
 
 		 222 aa  52.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  33.63 
 
 		 227 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  33.63 
 
 		 227 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  33.63 
 
 		 227 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2885  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.19 
 
 		 217 aa  52.8  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0973  transcriptional regulator  30.63 
 
 		 216 aa  52.8  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0354  DNA-binding response regulator  30.89 
 
 		 229 aa  52.4  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000041064  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2739  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 451 aa  52.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.693002  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1920  two component transcriptional regulator  31.86 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000662196  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2037  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.41 
 
 		 227 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0680  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 418 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.736075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1675  two component heavy metal response transcriptional regulator  28.7 
 
 		 226 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1927  two component transcriptional regulator  31.86 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000341688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2083  two component transcriptional regulator  31.86 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.129585  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1585  two component transcriptional regulator  26.02 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346975  normal  0.0159834 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0124  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4558  two component heavy metal response transcriptional regulator  27.68 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1482  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28 
 
 		 458 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.712271  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1894  two component transcriptional regulator  31.86 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000765732  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2032  DNA-binding response regulator  26.09 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0270369  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  26.05 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0904  two component Fis family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 454 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3156  two component transcriptional regulator  25.44 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0570697 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1623  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 470 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.46747  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.09 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.904967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2714  two component transcriptional regulator  27.43 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3511  two component transcriptional regulator  25.44 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  23.7 
 
 		 357 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  23.7 
 
 		 357 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  23.7 
 
 		 357 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.17 
 
 		 230 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3454  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.9 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  27.83 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2399  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.86 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00272  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0827  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 447 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0984  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 455 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1311  two component transcriptional regulator  27.5 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0732  cell cycle transcriptional regulator  29.06 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0817  response regulator receiver: C terminal  30.51 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0415499  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  26.96 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0376  DNA-binding response regulator IrlR  25 
 
 		 230 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.083776  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1012  DNA-binding response regulator  30.51 
 
 		 265 aa  50.8  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0213425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>