More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2499 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2499  translation elongation factor P (EF-P)  100 
 
 		 187 aa  381  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1531  translation elongation factor P (EF-P)  56.15 
 
 		 186 aa  221  7e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00313257  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4276  translation elongation factor P  48.13 
 
 		 186 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0449484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  43.62 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  44.92 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  43.62 
 
 		 187 aa  157  8e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  45.7 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2675  elongation factor P  42.25 
 
 		 188 aa  154  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241431  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  40.86 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  42.47 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  40.11 
 
 		 187 aa  151  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  41.71 
 
 		 188 aa  150  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  39.25 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  40.53 
 
 		 185 aa  148  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0361  elongation factor P  41.71 
 
 		 188 aa  148  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  42.02 
 
 		 186 aa  147  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2901  elongation factor P  41.49 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0923486  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  41.18 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  41.94 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  43.01 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  45.16 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1958  elongation factor P  41.18 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000139514  normal  0.25468 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  42.78 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  39.78 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  40.32 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1054  elongation factor P  40.54 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  39.78 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  42.25 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  41.53 
 
 		 188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  41.62 
 
 		 185 aa  144  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  40.32 
 
 		 187 aa  144  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  43.85 
 
 		 185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  43.01 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  43.01 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1758  elongation factor P  40.96 
 
 		 188 aa  144  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.141605  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0237  elongation factor P  40.11 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  40.32 
 
 		 187 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  40.86 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  39.78 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  38.71 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  39.68 
 
 		 211 aa  142  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  42.25 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3411  elongation factor P  40.64 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186085  normal  0.564269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  39.57 
 
 		 187 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  39.79 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1518  elongation factor P  40.64 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0673  translation elongation factor P  41.03 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  39.78 
 
 		 187 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  39.04 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  41.94 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  43.55 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  38.71 
 
 		 186 aa  141  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  41.18 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0200  elongation factor P  39.04 
 
 		 188 aa  141  7e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324451  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  40.54 
 
 		 186 aa  140  8e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  39.78 
 
 		 187 aa  140  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  39.78 
 
 		 187 aa  140  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  39.78 
 
 		 187 aa  140  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  41.08 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1542  translation elongation factor P  41.94 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  0.0365403 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  39.15 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  39.38 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  41.62 
 
 		 185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08176  translation elongation factor P  39.04 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.838989  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0568  elongation factor P  39.89 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2480  elongation factor P  44.32 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.272577  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1702  elongation factor P  40.32 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452132  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0323  elongation factor P  37.97 
 
 		 233 aa  138  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0872973  normal  0.0117476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  40.54 
 
 		 185 aa  137  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  38.38 
 
 		 190 aa  138  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_002950  PG1274  elongation factor P  39.89 
 
 		 188 aa  137  7e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  38.17 
 
 		 187 aa  137  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  37.1 
 
 		 187 aa  137  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  37.63 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5247  translation elongation factor P  40.43 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  43.32 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  43.32 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  41.4 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  41.94 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0920  translation elongation factor P  39.34 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  41.4 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  40.64 
 
 		 188 aa  135  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  43.01 
 
 		 185 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  43.01 
 
 		 185 aa  135  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  43.01 
 
 		 185 aa  135  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  43.01 
 
 		 185 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  43.01 
 
 		 185 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  42.47 
 
 		 185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  37.63 
 
 		 187 aa  134  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2529  translation elongation factor P  40.11 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0006044  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  38.62 
 
 		 189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  38.25 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  37.3 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  39.25 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  38.92 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0714  hypothetical protein  38.3 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.469656 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  38.38 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>