96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1947 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1947  oxidoreductase  100 
 
 
316 aa  655    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.561644  normal  0.0392107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1104  aldo/keto reductase  42.09 
 
 
329 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1756  aldo/keto reductase  40 
 
 
325 aa  205  9e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.64545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2236  aldo/keto reductase  37.54 
 
 
304 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110075  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3096  aldo/keto reductase  40.13 
 
 
327 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0474287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3196  aldo/keto reductase  40.13 
 
 
327 aa  198  9e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3291  aldo/keto reductase  39.81 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.343705  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22060  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  38.36 
 
 
312 aa  196  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.136763  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2974  aldo/keto reductase  37.19 
 
 
334 aa  192  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0118677  normal  0.0147407 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1925  aldo/keto reductase  38.39 
 
 
329 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.251191  normal  0.483599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2955  aldo/keto reductase  37.23 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7472  aldo/keto reductase  38.32 
 
 
324 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0134  aldo/keto reductase  35.08 
 
 
303 aa  168  9e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.165242  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4804  aldo/keto reductase  27.92 
 
 
270 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39186  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0486  aldo/keto reductase  28.46 
 
 
270 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243692  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4932  aldo/keto reductase  27.92 
 
 
270 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5009  aldo/keto reductase  26.83 
 
 
328 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4981  aldo/keto reductase  26.88 
 
 
270 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480582  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0539  aldo/keto reductase  26.91 
 
 
271 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0615  aldo/keto reductase  30.26 
 
 
270 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  24.65 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0534  aldo/keto reductase  26.6 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.043929 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44630  Aldo/keto reductase family protein  26.92 
 
 
272 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0940461  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4981  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.58 
 
 
271 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  24.4 
 
 
339 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  26.59 
 
 
329 aa  53.1  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0400  aldo/keto reductase  24.77 
 
 
346 aa  52.8  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  23.55 
 
 
329 aa  52.8  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  24.66 
 
 
314 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0446  aldo/keto reductase  25.37 
 
 
283 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00031204  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08733  conserved hypothetical protein  25.36 
 
 
351 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1573  aldo/keto reductase  26.19 
 
 
331 aa  50.4  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.91818  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0329  aldo/keto reductase  23.13 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4306  aldo/keto reductase  26.15 
 
 
332 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2292  aldo/keto reductase  25.76 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  35.8 
 
 
334 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  23.05 
 
 
376 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0764  aldo/keto reductase  24.07 
 
 
288 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0414529 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  25.95 
 
 
343 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.56 
 
 
341 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0202  oxidoreductase  24.01 
 
 
302 aa  46.6  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5727  hypothetical protein  25.18 
 
 
270 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2291  aldo/keto reductase  29.55 
 
 
293 aa  46.6  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77944 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  25.44 
 
 
326 aa  46.2  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3403  putative aldo-keto reductase  25.39 
 
 
353 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000401473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1564  aldo/keto reductase  24.82 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14600  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  23.28 
 
 
352 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  24.91 
 
 
352 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  24.35 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0743  aldo/keto reductase  26.04 
 
 
347 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.357174  normal  0.545888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  41.56 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  22.39 
 
 
319 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2253  aldo/keto reductase  24.44 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1959  aldo/keto reductase  28.12 
 
 
251 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0033  aldo/keto reductase  22.91 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  41.56 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1283  aldo/keto reductase  25.55 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66010  hypothetical protein  25.11 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0637322  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  23.4 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0299722 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10217  aldo-keto reductase (AKR13), puatative (AFU_orthologue; AFUA_7G00700)  23.73 
 
 
339 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.315653 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  23.47 
 
 
340 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01490  conserved hypothetical protein  25.17 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1685  aldo/keto reductase  22.46 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0361  aldo/keto reductase  24.57 
 
 
306 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  26.6 
 
 
346 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4002  aldo/keto reductase  25.82 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_194  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  24.47 
 
 
324 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00647949  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1182  aldo/keto reductase  23.68 
 
 
334 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3927  aldo/keto reductase  26.03 
 
 
304 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.185405  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0458  aldo/keto reductase  25.34 
 
 
317 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3852  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.94 
 
 
304 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95974  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2573  aldo/keto reductase  23.64 
 
 
337 aa  43.5  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129048  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  24.4 
 
 
311 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0899  putative aldo-keto reductase  25.32 
 
 
346 aa  43.5  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5322  aldo/keto reductase  22.34 
 
 
293 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0362532 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  40.48 
 
 
346 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  20 
 
 
378 aa  43.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3061  aldo/keto reductase  22.15 
 
 
326 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  24.46 
 
 
322 aa  43.1  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  27.14 
 
 
346 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2301  aldo/keto reductase  22.42 
 
 
332 aa  43.1  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  22.22 
 
 
350 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4574  aldo/keto reductase  30.25 
 
 
319 aa  42.7  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.330115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  26.24 
 
 
303 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0136  aldo/keto reductase  23.05 
 
 
324 aa  42.7  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4165  lolS protein  26.33 
 
 
304 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6541  aldo/keto reductase  23.19 
 
 
288 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  26.24 
 
 
272 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3802  aldo/keto reductase  25.26 
 
 
293 aa  42.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3045  aldo/keto reductase  24.38 
 
 
343 aa  42.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0449  aldo/keto reductase  22.22 
 
 
300 aa  42.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0217  aldo/keto reductase family oxidoreductase  23.31 
 
 
324 aa  42.4  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.68 
 
 
336 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  22.42 
 
 
328 aa  42.4  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0602  oxidoreductase  36.49 
 
 
373 aa  42.4  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.68 
 
 
336 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>