More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_194 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_194  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  100 
 
 
324 aa  661    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00647949  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0217  aldo/keto reductase family oxidoreductase  93.52 
 
 
324 aa  626  1e-178  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0136  aldo/keto reductase  89.78 
 
 
324 aa  604  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0929  aldo/keto reductase  44.94 
 
 
334 aa  258  8e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0411509  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2010  aryl-alcohol dehydrogenase  41.01 
 
 
324 aa  256  4e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0644  aldo/keto reductase  41.01 
 
 
315 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282625  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0026  hypothetical protein  37.74 
 
 
325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0458  aldo/keto reductase  37.5 
 
 
314 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0654121  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0494  aldo/keto reductase  37.79 
 
 
318 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4115  aldo/keto reductase  38.44 
 
 
315 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.905016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3927  aldo/keto reductase  37.31 
 
 
321 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.124161 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4579  aldo/keto reductase  36.19 
 
 
312 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  35.33 
 
 
317 aa  160  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1786  aldo/keto reductase  35.65 
 
 
317 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.561691 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1002  aldo/keto reductase  34.7 
 
 
317 aa  150  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2308  aldo/keto reductase  36.14 
 
 
373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0492  aldo/keto reductase  34.63 
 
 
311 aa  142  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.339705 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01490  conserved hypothetical protein  30.95 
 
 
334 aa  139  6e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  32.39 
 
 
319 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  33.84 
 
 
318 aa  138  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2905  aldo/keto reductase  34.94 
 
 
329 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789445  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  31.87 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  31.31 
 
 
358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  31.76 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  32.2 
 
 
338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  32.14 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0804  aldo/keto reductase  35.13 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  34.38 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  30.97 
 
 
361 aa  133  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  29.18 
 
 
342 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  32.06 
 
 
274 aa  132  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  32.06 
 
 
274 aa  132  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  30.77 
 
 
327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  31.4 
 
 
339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4616  aldo/keto reductase  31.85 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0526321  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  30.72 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  32.09 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  32.29 
 
 
319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.22 
 
 
311 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5143  aldo/keto reductase  33.93 
 
 
333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  33.13 
 
 
333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  31.35 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  31.19 
 
 
331 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  30.75 
 
 
326 aa  125  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  29.55 
 
 
319 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  31.82 
 
 
339 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2155  aldo/keto reductase  31.31 
 
 
326 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2390  aldo/keto reductase  29.66 
 
 
336 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000519885  hitchhiker  0.000458148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  31.58 
 
 
320 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  31.44 
 
 
360 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  31.82 
 
 
339 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  31.82 
 
 
353 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  31.96 
 
 
319 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.42 
 
 
327 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  28.31 
 
 
351 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  28.31 
 
 
351 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  29.31 
 
 
316 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  31.08 
 
 
316 aa  123  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  31.07 
 
 
330 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  28.31 
 
 
351 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49777  predicted protein  30.22 
 
 
418 aa  123  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  31.25 
 
 
332 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  30.49 
 
 
345 aa  122  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  31.35 
 
 
315 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  31.53 
 
 
309 aa  122  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0448  aldo/keto reductase  31.25 
 
 
348 aa  122  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  29.39 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  30.42 
 
 
349 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.15 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2380  aldo/keto reductase  28.01 
 
 
316 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.919819999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28620  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  32.92 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  29.09 
 
 
351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  29.08 
 
 
311 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1807  aldo/keto reductase  29.47 
 
 
314 aa  120  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0131606 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  29.94 
 
 
327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0716  aldo/keto reductase  31.86 
 
 
306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.93631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3310  aldo/keto reductase  31.4 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108449  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  30.12 
 
 
349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15540  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  30.46 
 
 
337 aa  119  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  29.09 
 
 
370 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  32.72 
 
 
354 aa  119  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  30.06 
 
 
313 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  30.37 
 
 
312 aa  119  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  27.71 
 
 
311 aa  119  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4915  aldo/keto reductase  35.56 
 
 
348 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000579413  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  30.37 
 
 
312 aa  119  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3183  aldo/keto reductase  30.4 
 
 
330 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  29.14 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12321  hypothetical protein  34.28 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.17 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.46 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.17 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.17 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  34.57 
 
 
323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1670  aldo/keto reductase  30.5 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  30.72 
 
 
350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  32.12 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.17 
 
 
311 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  29.79 
 
 
325 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  31.17 
 
 
352 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>