35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1836 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1836  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  331  3e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376011  normal  0.0442919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0833  hypothetical protein  51.61 
 
 
221 aa  155  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3808  hypothetical protein  45 
 
 
226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  41.88 
 
 
217 aa  123  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0903  hypothetical protein  40.62 
 
 
217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0961  hypothetical protein  40.62 
 
 
217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  40 
 
 
217 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1131  hypothetical protein  40.62 
 
 
217 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  38.75 
 
 
217 aa  117  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2268  hypothetical protein  34.69 
 
 
219 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.050147  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4852  hypothetical protein  36.81 
 
 
251 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384065  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  36.91 
 
 
228 aa  98.6  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3229  hypothetical protein  37.5 
 
 
214 aa  96.3  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.892596  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  31.98 
 
 
238 aa  92.8  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4274  hypothetical protein  29.89 
 
 
227 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0531  hypothetical protein  31.9 
 
 
228 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2418  hypothetical protein  34.64 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0101  hypothetical protein  29.27 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.667597  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0061  hypothetical protein  28.1 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0608  hypothetical protein  34.19 
 
 
249 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1966  hypothetical protein  26.99 
 
 
237 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1806  hypothetical protein  28.66 
 
 
275 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0349217  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1524  hypothetical protein  28.39 
 
 
239 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00235221  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0852  hypothetical protein  26.99 
 
 
260 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  24.86 
 
 
308 aa  54.3  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6517  hypothetical protein  23.12 
 
 
270 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2472  hypothetical protein  27.04 
 
 
280 aa  52  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1316  hypothetical protein  26.83 
 
 
220 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2320  hypothetical protein  23.68 
 
 
246 aa  48.5  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3847  hypothetical protein  29.11 
 
 
254 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142679  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1051  hypothetical protein  30.14 
 
 
223 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5958  hypothetical protein  25.62 
 
 
238 aa  44.7  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2277  hypothetical protein  27.67 
 
 
211 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.691204  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6704  hypothetical protein  26.28 
 
 
212 aa  40.8  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0710  hypothetical protein  21.37 
 
 
215 aa  40.4  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>