More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0340 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0340  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  502  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1735  pirin domain-containing protein  55.36 
 
 		 238 aa  278  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0380  Pirin domain protein  54.74 
 
 		 236 aa  276  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.489995 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09076  possible Pirin family protein  51.5 
 
 		 238 aa  271  5.000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5011  Pirin domain protein  49.58 
 
 		 239 aa  250  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.118711  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2096  pirin-related protein  48.94 
 
 		 268 aa  246  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.295198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1544  Pirin-like  48.72 
 
 		 236 aa  239  4e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.10868  normal  0.29614 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0621  pirin domain-containing protein  46.15 
 
 		 235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000898789  normal  0.199637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0356  Pirin domain protein  47.41 
 
 		 238 aa  231  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00920786  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1402  Pirin family proteins  47.46 
 
 		 236 aa  231  1e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000212208  normal  0.0720528 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2303  pirin domain-containing protein  47.84 
 
 		 237 aa  229  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000285966  normal  0.0109374 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1827  Pirin domain protein  46.55 
 
 		 232 aa  223  3e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0905594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3182  Pirin domain protein  43.4 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2162  pirin domain-containing protein  44.59 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1092  cupin domain-containing protein  46.09 
 
 		 232 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1502  Pirin domain protein  42.92 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.231424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2406  Pirin domain protein  41.99 
 
 		 232 aa  188  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0103  Pirin-like  40.34 
 
 		 245 aa  188  8e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47850  Pirin-like protein  39.22 
 
 		 242 aa  187  9e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3608  Pirin, N-terminal  43.04 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694898  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1250  hypothetical protein  45.65 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2012  Pirin domain protein  41.56 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.990262 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1123  Pirin domain protein  42.61 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1097  cupin domain-containing protein  45.22 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0891  hypothetical protein  44.35 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0902  Pirin, N-terminal  43.91 
 
 		 232 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2579  Pirin-like protein  43.48 
 
 		 232 aa  185  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0288  Pirin domain protein  43.29 
 
 		 229 aa  185  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3389  hypothetical protein  42.61 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3853  hypothetical protein  42.37 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3095  Pirin domain protein  42.86 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000217046  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3811  hypothetical protein  42.37 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3733  protein YhhW  42.37 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3913  hypothetical protein  42.37 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.356203 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3903  pirin domain-containing protein  43.53 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0276  Pirin domain protein  41.95 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3847  pirin domain-containing protein  42.24 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1833  Pirin-like protein  43.51 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.441024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3744  protein YhhW  41.95 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0251  Pirin domain protein  41.38 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.320122  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03290  hypothetical protein  41.95 
 
 		 231 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32251  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3638  pirin family protein  41.95 
 
 		 231 aa  182  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.502653  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3886  pirin family protein  41.95 
 
 		 231 aa  182  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.688116  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5473  Pirin domain protein  43.04 
 
 		 239 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3917  pirin family protein  41.95 
 
 		 231 aa  182  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0274  pirin domain-containing protein  41.95 
 
 		 231 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3722  pirin family protein  41.95 
 
 		 231 aa  182  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03243  hypothetical protein  41.95 
 
 		 231 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1969  hypothetical protein  41.7 
 
 		 241 aa  181  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5198  hypothetical protein  43.5 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.312315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4753  pirin  43.05 
 
 		 232 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7633  Pirin-like protein  43.04 
 
 		 241 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00137  pirin, N-terminal  42.86 
 
 		 233 aa  181  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.071299  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4755  pirin family protein  41.95 
 
 		 231 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4908  hypothetical protein  43.05 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4772  pirin  43.05 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5283  hypothetical protein  43.05 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0585  cupin domain-containing protein  41.77 
 
 		 241 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1786  hypothetical protein  41.74 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1955  Pirin-like  41.81 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43440  Pirin-like, pirA  41.56 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.277134  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1976  hypothetical protein  41.28 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.162515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0678  cupin domain-containing protein  41.35 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2208  putative pirin-like protein  38.96 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677646  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6612  pirin domain-containing protein  43.04 
 
 		 241 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.404162 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5765  Pirin-like  43.04 
 
 		 241 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6130  pirin domain-containing protein  43.04 
 
 		 241 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4653  pirin domain-containing protein  40.52 
 
 		 231 aa  178  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5153  hypothetical protein  42.6 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000262926 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3945  Pirin domain protein  40.52 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0203  Pirin domain protein  42.49 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4143  Pirin domain protein  40.52 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1808  Pirin-like  41.74 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2268  hypothetical protein  40.69 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5842  pirin domain-containing protein  42.67 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0553  Pirin, N-terminal  39.66 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0060  hypothetical protein  41.7 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.225741  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6078  pirin domain-containing protein  42.67 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5189  hypothetical protein  42.15 
 
 		 232 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48650  hypothetical protein  40.27 
 
 		 232 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951515 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4103  hypothetical protein  41.2 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0133  pirin domain-containing protein  41.2 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.973345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4023  YhhW family protein  41.2 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5399  Pirin domain protein  41.3 
 
 		 241 aa  175  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102577  normal  0.0781504 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5184  hypothetical protein  42.15 
 
 		 232 aa  175  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.930395  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4168  hypothetical protein  39.82 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4868  pirin domain-containing protein  41.59 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4378  Pirin domain protein  37.02 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1168  Pirin domain protein  41.96 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1221  pirin domain-containing protein  40.09 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0758  pirin domain-containing protein  40 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.966518  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1210  hypothetical protein  40.43 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114398  normal  0.265926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0932  Pirin domain protein  38.26 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1546  hypothetical protein  39.39 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.105778  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1220  pirin domain-containing protein  39.66 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.110776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1291  pirin domain-containing protein  39.66 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0724956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3623  pirin domain-containing protein  41.26 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2664  pirin domain-containing protein  40.18 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0801192  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1963  Pirin domain protein  39.47 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.210241  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1638  Pirin-like  39.48 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>