More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1266 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0641  excinuclease ABC subunit C  64.17 
 
 		 607 aa  801    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.901377  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1382  excinuclease ABC subunit C  58.99 
 
 		 600 aa  691    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1559  excinuclease ABC subunit C  61.73 
 
 		 605 aa  796    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0480  excinuclease ABC subunit C  58.82 
 
 		 600 aa  689    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.867609  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0498  excinuclease ABC subunit C  61.41 
 
 		 597 aa  731    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0936  excinuclease ABC subunit C  61 
 
 		 607 aa  779    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1261  excinuclease ABC subunit C  58.82 
 
 		 600 aa  691    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1266  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 602 aa  1229    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0591  excinuclease ABC, C subunit  46 
 
 		 599 aa  536  1e-151  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0418  excinuclease ABC subunit C  45.18 
 
 		 600 aa  494  9.999999999999999e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  32.74 
 
 		 610 aa  298  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  31.66 
 
 		 624 aa  294  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0772  excinuclease ABC subunit C  32.91 
 
 		 633 aa  293  8e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00962744  normal  0.347624 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  32.96 
 
 		 623 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  32.96 
 
 		 623 aa  291  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  33.17 
 
 		 623 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4491  excinuclease ABC subunit C  31.31 
 
 		 642 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.191027 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  30.22 
 
 		 619 aa  288  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  32.17 
 
 		 631 aa  287  4e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  30.63 
 
 		 644 aa  284  4.0000000000000003e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4277  excinuclease ABC subunit C  32.39 
 
 		 634 aa  283  7.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5405  excinuclease ABC, C subunit  31.25 
 
 		 688 aa  282  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0782  excinuclease ABC subunit C  31.63 
 
 		 674 aa  282  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191761  normal  0.0714693 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  33.17 
 
 		 631 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  32.89 
 
 		 614 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  31.75 
 
 		 605 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  32.81 
 
 		 628 aa  281  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0420  excinuclease ABC subunit C  32.81 
 
 		 620 aa  281  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000882939  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  31.99 
 
 		 635 aa  280  4e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0046  excinuclease ABC subunit C  32.4 
 
 		 629 aa  280  5e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.714841  hitchhiker  0.00962006 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  32 
 
 		 620 aa  280  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  31.18 
 
 		 607 aa  279  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2878  excinuclease ABC, C subunit  31.05 
 
 		 682 aa  279  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  30.67 
 
 		 627 aa  279  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3104  excinuclease ABC, C subunit  31.05 
 
 		 682 aa  279  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299342  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  31.68 
 
 		 620 aa  277  5e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2276  excinuclease ABC, C subunit  31.24 
 
 		 644 aa  276  8e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  29.97 
 
 		 629 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2589  excinuclease ABC subunit C  31.18 
 
 		 691 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0718587  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0690  excinuclease ABC subunit C  31.82 
 
 		 690 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.485523  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0901  excinuclease ABC subunit C  31.39 
 
 		 699 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.686054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  31.46 
 
 		 613 aa  274  4.0000000000000004e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0699  excinuclease ABC subunit C  31.66 
 
 		 690 aa  273  5.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  30.98 
 
 		 631 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  31.94 
 
 		 639 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  30.43 
 
 		 700 aa  273  9e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1975  excinuclease ABC subunit C  30.82 
 
 		 653 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2312  excinuclease ABC subunit C  32.22 
 
 		 623 aa  271  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136814 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  31.14 
 
 		 607 aa  270  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1712  excinuclease ABC, C subunit  31.37 
 
 		 692 aa  270  7e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  31.64 
 
 		 615 aa  270  8e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  31.24 
 
 		 618 aa  269  8.999999999999999e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  31.55 
 
 		 619 aa  269  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1086  excinuclease ABC subunit C  30.32 
 
 		 680 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000501867 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  31.4 
 
 		 618 aa  269  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  29.79 
 
 		 611 aa  269  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  31.73 
 
 		 615 aa  269  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  32.35 
 
 		 613 aa  268  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  32.02 
 
 		 625 aa  268  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  32.05 
 
 		 588 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  28.81 
 
 		 604 aa  268  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3713  excinuclease ABC, C subunit  31.88 
 
 		 668 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2652  excinuclease ABC, C subunit  31.88 
 
 		 668 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  30.76 
 
 		 601 aa  267  4e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  32.74 
 
 		 616 aa  267  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  28.82 
 
 		 611 aa  267  5e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  30.65 
 
 		 599 aa  266  8e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  30.05 
 
 		 617 aa  266  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  30.68 
 
 		 607 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  32.24 
 
 		 636 aa  265  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1558  excinuclease ABC subunit C  30.22 
 
 		 690 aa  264  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  30.51 
 
 		 608 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  29.69 
 
 		 608 aa  264  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  31.69 
 
 		 613 aa  264  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  30 
 
 		 617 aa  264  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  29.72 
 
 		 628 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  30.78 
 
 		 607 aa  263  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  31.09 
 
 		 607 aa  263  6e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0516  excinuclease ABC subunit C  31.31 
 
 		 658 aa  263  8e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0205  excinuclease ABC subunit C  30.89 
 
 		 614 aa  263  8.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0351181  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  31.54 
 
 		 607 aa  263  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2013  excinuclease ABC subunit C  31.07 
 
 		 614 aa  262  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.117598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1177  excinuclease ABC subunit C  31.29 
 
 		 695 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.8668  normal  0.100977 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1276  excinuclease ABC subunit C  31.93 
 
 		 609 aa  262  2e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00138903  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1281  excinuclease ABC subunit C  30.65 
 
 		 695 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280524  normal  0.136737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2316  excinuclease ABC subunit C  31.07 
 
 		 645 aa  261  3e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.682688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1334  excinuclease ABC subunit C  32.09 
 
 		 609 aa  261  3e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000285239  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  30.72 
 
 		 591 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  29.49 
 
 		 622 aa  260  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  31.04 
 
 		 607 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  30.52 
 
 		 607 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  30.24 
 
 		 617 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  30.24 
 
 		 617 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  29.87 
 
 		 608 aa  259  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  30.67 
 
 		 612 aa  259  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  30.36 
 
 		 607 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  29.87 
 
 		 623 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  31.44 
 
 		 604 aa  258  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  30.66 
 
 		 599 aa  258  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  31.03 
 
 		 609 aa  257  5e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>