More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0851 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0851  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00201789  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1981  hypothetical protein  64.12 
 
 
134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1067  hypothetical protein  61.03 
 
 
136 aa  160  5.0000000000000005e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1238  hypothetical protein  63.78 
 
 
132 aa  156  8e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1331  hypothetical protein  56.39 
 
 
135 aa  150  8e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0694  hypothetical protein  55.64 
 
 
135 aa  149  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0769  hypothetical protein  54.89 
 
 
135 aa  147  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0752  conserved hypothetical protein (UPF0079 domain protein)  54.96 
 
 
135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1150  hypothetical protein  48.51 
 
 
137 aa  120  5e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.864213  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1024  protein of unknown function UPF0079  44.44 
 
 
143 aa  107  7.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  34.78 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  36.5 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  36.36 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  41.67 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  37.21 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  38.3 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  40.51 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  35 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  36.47 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  36.47 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  38.71 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  40.51 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  40.51 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  40.51 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  40.51 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  40.51 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  40.51 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  40.51 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  36.78 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  40.51 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0583  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 
159 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  37.5 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  36.67 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  38.71 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  28.79 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  32.73 
 
 
152 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0134  hypothetical protein  37.11 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3462  protein of unknown function UPF0079  30 
 
 
169 aa  62.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  40.51 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  32.73 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1926  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.47 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  34.52 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  36.14 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  33.64 
 
 
172 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  35.05 
 
 
168 aa  61.6  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  30.95 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  37.27 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  42.17 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1598  protein of unknown function UPF0079  36.47 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.86964  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  37.97 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0008  P-loop hydrolase family protein  37.62 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000890288  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  37.89 
 
 
165 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  33.96 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  34.07 
 
 
164 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  34.07 
 
 
164 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  30.85 
 
 
156 aa  60.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  31.91 
 
 
161 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2993  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 
140 aa  60.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.093768  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  35.8 
 
 
160 aa  60.5  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1130  hypothetical protein  27.1 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.30959 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0899  protein of unknown function UPF0079  33.73 
 
 
169 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl495  ATPase  37.97 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  34.29 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  35 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0121  hypothetical protein  42.68 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  36.51 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  30.11 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3882  protein of unknown function UPF0079  33.64 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  34.07 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  35.92 
 
 
150 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3302  hypothetical protein  32.94 
 
 
183 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749162  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3198  hypothetical protein  29.2 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.250751  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0161  hypothetical protein  34.12 
 
 
164 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2026  hypothetical protein  29.91 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2816  protein of unknown function UPF0079  30.19 
 
 
192 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.559153  normal  0.894815 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  38.75 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  28.72 
 
 
157 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  29.57 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  29.46 
 
 
166 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  39.29 
 
 
176 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1306  hypothetical protein  27.88 
 
 
181 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134603  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10268  putative ATP/GTP-binding transmembrane protein  30.93 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.636106  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  36.73 
 
 
163 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1171  hypothetical protein  34.04 
 
 
172 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00361416  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  36.14 
 
 
143 aa  57.8  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  35.56 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  32.61 
 
 
158 aa  57.8  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  36.96 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  32.53 
 
 
160 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  32.53 
 
 
160 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0525  hypothetical protein  30.48 
 
 
177 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244934 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2410  protein of unknown function UPF0079  30.69 
 
 
192 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  30.36 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  36.25 
 
 
153 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  32.56 
 
 
154 aa  57.8  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0670  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169194  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  36.25 
 
 
152 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0439  protein of unknown function UPF0079  31.87 
 
 
153 aa  57  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  36.25 
 
 
152 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0594287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>