More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0547 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0547  malic enzyme NAD binding subunit  100 
 
 		 417 aa  838    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.199377  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0241  transketolase A  92.33 
 
 		 417 aa  715    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  79.13 
 
 		 424 aa  619  1e-176  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.031884  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1560  NADP-dependent malic enzyme  76.7 
 
 		 415 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00518562  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0112  NADP-dependent malic enzyme (NADP-me)  69.27 
 
 		 415 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1292  malate oxidoreductase  68.87 
 
 		 411 aa  520  1e-146  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  62.56 
 
 		 752 aa  511  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  60.14 
 
 		 759 aa  512  1e-144  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1479  NADP-dependent malic enzyme, truncation  67.65 
 
 		 411 aa  501  1e-140  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.511152  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  60.77 
 
 		 754 aa  500  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1304  NADP-dependent malic enzyme, truncation  67.4 
 
 		 411 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  61.72 
 
 		 773 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  59.81 
 
 		 753 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0435  NADP-dependent malic enzyme, truncation  66.91 
 
 		 411 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5085  malic enzyme  61.15 
 
 		 422 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4958  malate dehydrogenase  61.15 
 
 		 425 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0380  malate dehydrogenase  61.15 
 
 		 425 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  59.9 
 
 		 752 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5135  malate dehydrogenase  61.4 
 
 		 425 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1765  malate dehydrogenase  60.65 
 
 		 422 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188072 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  59.37 
 
 		 749 aa  484  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  59.47 
 
 		 779 aa  487  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  58.17 
 
 		 752 aa  485  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  57.89 
 
 		 760 aa  485  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5134  malic enzyme family protein  60.6 
 
 		 422 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0185619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0401  malate dehydrogenase  60.9 
 
 		 422 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  58.88 
 
 		 749 aa  482  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0403  malic enzyme, NAD-binding  60.9 
 
 		 450 aa  482  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  59.71 
 
 		 780 aa  484  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45330  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  59.85 
 
 		 422 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  57.42 
 
 		 759 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  60.29 
 
 		 771 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  60.34 
 
 		 749 aa  478  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4039  malic enzyme  60.29 
 
 		 771 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601427  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  58.17 
 
 		 757 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  57.42 
 
 		 751 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  58.11 
 
 		 771 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  58.11 
 
 		 766 aa  477  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2970  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  59.35 
 
 		 412 aa  475  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.017346  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  57.21 
 
 		 754 aa  478  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  59.32 
 
 		 752 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1209  oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase (NADP(+)) phosphate acetyltransferase  58.65 
 
 		 761 aa  472  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000448619 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1539  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  60.77 
 
 		 439 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.664121 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3061  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  60.29 
 
 		 440 aa  474  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4968  malic enzyme  56.83 
 
 		 762 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  56.59 
 
 		 757 aa  473  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66680  malic enzyme  60.9 
 
 		 422 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5783  malic enzyme  60.65 
 
 		 422 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  57.08 
 
 		 783 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4217  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  60.34 
 
 		 764 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.665335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  56.7 
 
 		 754 aa  468  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2520  malate dehydrogenase  59.09 
 
 		 439 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.6438  normal  0.0151254 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0824  malate dehydrogenase  58.27 
 
 		 421 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00610824  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  58.98 
 
 		 777 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0500  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+)), Phosphate acetyltransferase  57.69 
 
 		 751 aa  466  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  58.88 
 
 		 773 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  59.18 
 
 		 752 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2106  malic enzyme  58.89 
 
 		 765 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1181  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  60.37 
 
 		 407 aa  462  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.682701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0448  malic enzyme  58.8 
 
 		 758 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0461  malic enzyme  58.8 
 
 		 758 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0951563 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4071  malic enzyme  60.29 
 
 		 771 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  56.84 
 
 		 759 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  56.84 
 
 		 759 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  56.84 
 
 		 759 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2654  malic enzyme  56.46 
 
 		 751 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.820528 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0540  malate dehydrogenase  59.9 
 
 		 422 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0298  malic enzyme  56.8 
 
 		 756 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000250182 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  56.84 
 
 		 759 aa  459  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  56.84 
 
 		 759 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0265  malic enzyme  54.46 
 
 		 764 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.8165  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  57.21 
 
 		 763 aa  458  9.999999999999999e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3292  malic enzyme  55.66 
 
 		 759 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3684  malic enzyme  56.84 
 
 		 759 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.392037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0093  malic enzyme  57.21 
 
 		 769 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.351367  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0295  malic enzyme  54.46 
 
 		 764 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02316  hypothetical protein  56.84 
 
 		 759 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0605  malate dehydrogenase  55.06 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  56.84 
 
 		 759 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2877  malic enzyme  56.73 
 
 		 751 aa  458  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.857329 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  56.8 
 
 		 756 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2378  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  59.01 
 
 		 406 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0813409  normal  0.0779687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4123  malate dehydrogenase  57.43 
 
 		 422 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0085913  hitchhiker  0.00000090727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1324  malic enzyme  58.7 
 
 		 749 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.591813  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0754  malic enzyme  56.13 
 
 		 759 aa  458  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0943824  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  56.8 
 
 		 756 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  57.04 
 
 		 759 aa  458  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  56.84 
 
 		 759 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  56.8 
 
 		 756 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  56.37 
 
 		 759 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2300  malate dehydrogenase  55.91 
 
 		 414 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  56.32 
 
 		 756 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  56.32 
 
 		 756 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  56.32 
 
 		 756 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  56.56 
 
 		 756 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2838  malic enzyme  56.37 
 
 		 759 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  56.32 
 
 		 756 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  56.32 
 
 		 756 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  56.32 
 
 		 756 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  56.13 
 
 		 759 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>