More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2195 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0547  malic enzyme NAD binding subunit  79.51 
 
 		 417 aa  637    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.199377  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  100 
 
 		 424 aa  863    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.031884  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0241  transketolase A  79.76 
 
 		 417 aa  601  1.0000000000000001e-171  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1560  NADP-dependent malic enzyme  73.54 
 
 		 415 aa  587  1e-166  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00518562  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0112  NADP-dependent malic enzyme (NADP-me)  66.91 
 
 		 415 aa  556  1e-157  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  63.31 
 
 		 752 aa  524  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  62.8 
 
 		 773 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  61.93 
 
 		 779 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1292  malate oxidoreductase  66.99 
 
 		 411 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  60.67 
 
 		 752 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  61.69 
 
 		 780 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  60.92 
 
 		 749 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4039  malic enzyme  62.26 
 
 		 771 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601427  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  60.92 
 
 		 749 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  59.71 
 
 		 753 aa  504  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  62.26 
 
 		 771 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  59.2 
 
 		 754 aa  504  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  58.96 
 
 		 760 aa  499  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  58.06 
 
 		 752 aa  495  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  58.7 
 
 		 759 aa  491  1e-137  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  58.75 
 
 		 757 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  57.98 
 
 		 759 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  57.98 
 
 		 751 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  60.87 
 
 		 752 aa  486  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4958  malate dehydrogenase  60.1 
 
 		 425 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  58.07 
 
 		 771 aa  482  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3061  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  61.48 
 
 		 440 aa  483  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  61.76 
 
 		 752 aa  481  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  60.82 
 
 		 749 aa  484  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4071  malic enzyme  61.79 
 
 		 771 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4968  malic enzyme  56.6 
 
 		 762 aa  481  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5085  malic enzyme  60.1 
 
 		 422 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2877  malic enzyme  58.04 
 
 		 751 aa  481  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.857329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0380  malate dehydrogenase  59.85 
 
 		 425 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5135  malate dehydrogenase  59.85 
 
 		 425 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  57.31 
 
 		 754 aa  479  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1324  malic enzyme  61.15 
 
 		 749 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.591813  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0401  malate dehydrogenase  59.6 
 
 		 422 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0403  malic enzyme, NAD-binding  59.4 
 
 		 450 aa  477  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1765  malate dehydrogenase  59.4 
 
 		 422 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66680  malic enzyme  61.15 
 
 		 422 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  59.02 
 
 		 759 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  59.02 
 
 		 759 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5783  malic enzyme  60.9 
 
 		 422 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1479  NADP-dependent malic enzyme, truncation  64.3 
 
 		 411 aa  474  1e-132  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.511152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5134  malic enzyme family protein  59.6 
 
 		 422 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0185619  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0435  NADP-dependent malic enzyme, truncation  64.06 
 
 		 411 aa  471  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  59.02 
 
 		 759 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02316  hypothetical protein  59.02 
 
 		 759 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  59.02 
 
 		 759 aa  471  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  57.62 
 
 		 766 aa  472  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2106  malic enzyme  57.68 
 
 		 765 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  58.27 
 
 		 754 aa  472  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  59.02 
 
 		 759 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  59.02 
 
 		 759 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  59.02 
 
 		 759 aa  472  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3684  malic enzyme  59.02 
 
 		 759 aa  472  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.392037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2959  malic enzyme  61.95 
 
 		 749 aa  471  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  58.92 
 
 		 759 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  56.09 
 
 		 757 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1304  NADP-dependent malic enzyme, truncation  64.06 
 
 		 411 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3352  malic enzyme  57.07 
 
 		 763 aa  468  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2616  malic enzyme  58.92 
 
 		 759 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  58.92 
 
 		 759 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0500  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+)), Phosphate acetyltransferase  57.55 
 
 		 751 aa  470  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2838  malic enzyme  58.92 
 
 		 759 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2731  malic enzyme  58.92 
 
 		 759 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  56.13 
 
 		 757 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2654  malic enzyme  57.28 
 
 		 751 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.820528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0158  malic enzyme  57.45 
 
 		 764 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45330  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  58.85 
 
 		 422 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  56.6 
 
 		 783 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  58.19 
 
 		 759 aa  467  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0824  malate dehydrogenase  59 
 
 		 421 aa  464  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00610824  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1209  oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase (NADP(+)) phosphate acetyltransferase  58.05 
 
 		 761 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000448619 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2520  malate dehydrogenase  59 
 
 		 439 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.6438  normal  0.0151254 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  56.22 
 
 		 758 aa  461  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  57.11 
 
 		 777 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0540  malate dehydrogenase  60.15 
 
 		 422 aa  461  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2471  malic protein NAD-binding protein  59.41 
 
 		 751 aa  463  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4217  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  59.18 
 
 		 764 aa  464  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.665335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1243  malic enzyme  55.71 
 
 		 769 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0048  malic enzyme  55.88 
 
 		 761 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3292  malic enzyme  57.46 
 
 		 759 aa  464  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1539  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  59.72 
 
 		 439 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.664121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7102  malic enzyme  56.76 
 
 		 763 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30073  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3020  malic enzyme  55.58 
 
 		 761 aa  464  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0754  malic enzyme  57.21 
 
 		 759 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0943824  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0461  malic enzyme  58.31 
 
 		 758 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0951563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1421  malic enzyme  56.94 
 
 		 767 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3213  malic enzyme  55.61 
 
 		 759 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2970  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  57.11 
 
 		 412 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.017346  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0605  malate dehydrogenase  56.25 
 
 		 432 aa  460  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  56.87 
 
 		 773 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  57.24 
 
 		 759 aa  461  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4123  malate dehydrogenase  58.15 
 
 		 422 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0085913  hitchhiker  0.00000090727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0448  malic enzyme  58.31 
 
 		 758 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0295  malic enzyme  54.68 
 
 		 764 aa  455  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6546  malic enzyme  56.27 
 
 		 763 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00415909  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1298  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP+)  57 
 
 		 440 aa  455  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>