More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1479 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1479  NADP-dependent malic enzyme, truncation  100 
 
 
411 aa  822    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.511152  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0435  NADP-dependent malic enzyme, truncation  98.05 
 
 
411 aa  808    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1304  NADP-dependent malic enzyme, truncation  99.27 
 
 
411 aa  818    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1292  malate oxidoreductase  83.94 
 
 
411 aa  633  1e-180  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0547  malic enzyme NAD binding subunit  67.65 
 
 
417 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.199377  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1560  NADP-dependent malic enzyme  66.02 
 
 
415 aa  527  1e-148  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00518562  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0112  NADP-dependent malic enzyme (NADP-me)  64.06 
 
 
415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0241  transketolase A  68.32 
 
 
417 aa  511  1e-144  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  64.3 
 
 
424 aa  499  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.031884  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  57.66 
 
 
752 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  58.68 
 
 
754 aa  466  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  57.18 
 
 
759 aa  463  1e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  55.4 
 
 
771 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  55.93 
 
 
757 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  56.72 
 
 
757 aa  459  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  56.6 
 
 
783 aa  456  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  56.22 
 
 
752 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  57.83 
 
 
773 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1765  malate dehydrogenase  56.44 
 
 
422 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.188072 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  56.39 
 
 
760 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  56.66 
 
 
766 aa  454  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45330  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  56.33 
 
 
422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  59.28 
 
 
771 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  57.25 
 
 
763 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5085  malic enzyme  55.83 
 
 
422 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14164  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4958  malate dehydrogenase  55.83 
 
 
425 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0403  malic enzyme, NAD-binding  55.45 
 
 
450 aa  448  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  56.39 
 
 
753 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4039  malic enzyme  58.31 
 
 
771 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601427  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5135  malate dehydrogenase  56.08 
 
 
425 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0605  malate dehydrogenase  55.75 
 
 
432 aa  449  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0380  malate dehydrogenase  56.08 
 
 
425 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0500  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+)), Phosphate acetyltransferase  56.4 
 
 
751 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0401  malate dehydrogenase  55.58 
 
 
422 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215964  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  54.94 
 
 
752 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  56.14 
 
 
754 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  55.02 
 
 
779 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5134  malic enzyme family protein  55.58 
 
 
422 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0185619  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  56.14 
 
 
763 aa  442  1e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1181  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  57.96 
 
 
407 aa  442  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.682701  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  55.07 
 
 
759 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3061  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  58.11 
 
 
440 aa  443  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  55.93 
 
 
780 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4968  malic enzyme  56.66 
 
 
762 aa  443  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  55.69 
 
 
754 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5783  malic enzyme  55.93 
 
 
422 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4071  malic enzyme  59.04 
 
 
771 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2970  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  55.83 
 
 
412 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.017346  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2616  malic enzyme  54.92 
 
 
759 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2731  malic enzyme  54.92 
 
 
759 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  55.85 
 
 
758 aa  439  9.999999999999999e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  54.92 
 
 
759 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2838  malic enzyme  54.92 
 
 
759 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  54.92 
 
 
759 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  55.07 
 
 
751 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66680  malic enzyme  55.53 
 
 
422 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2378  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  58.21 
 
 
406 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0813409  normal  0.0779687 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0295  malic enzyme  53.49 
 
 
764 aa  435  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  54.55 
 
 
749 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4217  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  56.59 
 
 
764 aa  437  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.665335  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1209  oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase (NADP(+)) phosphate acetyltransferase  55.21 
 
 
761 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000448619 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  53.72 
 
 
759 aa  431  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0488  NADP-dependent malic enzyme  54.83 
 
 
440 aa  432  1e-120  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  53.72 
 
 
759 aa  431  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  54.42 
 
 
759 aa  434  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  53.48 
 
 
764 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0265  malic enzyme  53.49 
 
 
764 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.8165  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02316  hypothetical protein  53.72 
 
 
759 aa  431  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  54.55 
 
 
749 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  56.52 
 
 
752 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2911  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  53.27 
 
 
755 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  53.72 
 
 
759 aa  431  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  55.74 
 
 
752 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0048  malic enzyme  54.72 
 
 
761 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3292  malic enzyme  53.46 
 
 
759 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  53.72 
 
 
759 aa  431  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2058  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  55.11 
 
 
478 aa  431  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.384366  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  53.72 
 
 
759 aa  431  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2300  malate dehydrogenase  55.33 
 
 
414 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  53.72 
 
 
759 aa  431  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3213  malic enzyme  53.94 
 
 
759 aa  428  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0353  hypothetical protein  57 
 
 
424 aa  429  1e-119  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.326353 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0824  malate dehydrogenase  55.72 
 
 
421 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00610824  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3684  malic enzyme  53.72 
 
 
759 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.392037  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0033  malic enzyme  54.96 
 
 
761 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.43478 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  53.72 
 
 
759 aa  431  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  53.55 
 
 
757 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1243  malic enzyme  52.16 
 
 
769 aa  425  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4423  malate dehydrogenase  54.03 
 
 
415 aa  425  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  53.12 
 
 
758 aa  425  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0540  malate dehydrogenase  56.08 
 
 
422 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0298  malic enzyme  53.12 
 
 
756 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000250182 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0420  malic enzyme  55.39 
 
 
750 aa  426  1e-118  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  53.22 
 
 
759 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  52.16 
 
 
760 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1573  malic enzyme  54.09 
 
 
759 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  53.12 
 
 
756 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  55.98 
 
 
749 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  51.67 
 
 
776 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3020  malic enzyme  55.1 
 
 
761 aa  425  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>