More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1292 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1292  malate oxidoreductase  100 
 
 		 411 aa  827    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0435  NADP-dependent malic enzyme, truncation  83.94 
 
 		 411 aa  623  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1479  NADP-dependent malic enzyme, truncation  83.94 
 
 		 411 aa  622  1e-177  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.511152  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1304  NADP-dependent malic enzyme, truncation  83.7 
 
 		 411 aa  622  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0547  malic enzyme NAD binding subunit  68.87 
 
 		 417 aa  549  1e-155  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.199377  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1560  NADP-dependent malic enzyme  65.53 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00518562  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0112  NADP-dependent malic enzyme (NADP-me)  65.04 
 
 		 415 aa  524  1e-147  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  66.99 
 
 		 424 aa  524  1e-147  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.031884  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0241  transketolase A  67.89 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  58.61 
 
 		 752 aa  480  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  58.37 
 
 		 752 aa  478  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  58.6 
 
 		 780 aa  472  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  57.66 
 
 		 779 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  58.11 
 
 		 754 aa  469  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1765  malate dehydrogenase  57.46 
 
 		 422 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5135  malate dehydrogenase  57.86 
 
 		 425 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5085  malic enzyme  57.36 
 
 		 422 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14164  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  56.14 
 
 		 759 aa  462  1e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0380  malate dehydrogenase  57.61 
 
 		 425 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  57.83 
 
 		 773 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  56.39 
 
 		 760 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45330  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  57.36 
 
 		 422 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  54.92 
 
 		 771 aa  461  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4958  malate dehydrogenase  57.36 
 
 		 425 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  56.46 
 
 		 749 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0401  malate dehydrogenase  57.11 
 
 		 422 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  56.04 
 
 		 759 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0605  malate dehydrogenase  56.64 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2970  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  56.58 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.017346  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  55.9 
 
 		 752 aa  457  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5134  malic enzyme family protein  57.11 
 
 		 422 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0185619  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  57.21 
 
 		 766 aa  456  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0500  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+)), Phosphate acetyltransferase  57.14 
 
 		 751 aa  456  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0403  malic enzyme, NAD-binding  57.11 
 
 		 450 aa  455  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  56.04 
 
 		 751 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  56.46 
 
 		 749 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  56.14 
 
 		 754 aa  456  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  55.21 
 
 		 757 aa  457  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  55.18 
 
 		 757 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  56.37 
 
 		 783 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  56.12 
 
 		 753 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  58.31 
 
 		 771 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  56.94 
 
 		 752 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5783  malic enzyme  57.86 
 
 		 422 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  57 
 
 		 752 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4039  malic enzyme  57.59 
 
 		 771 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66680  malic enzyme  57.61 
 
 		 422 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4968  malic enzyme  56.17 
 
 		 762 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  56.14 
 
 		 763 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3061  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  57.87 
 
 		 440 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  54.57 
 
 		 758 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1181  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  56.14 
 
 		 407 aa  442  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.682701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2471  malic protein NAD-binding protein  57.64 
 
 		 751 aa  442  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0824  malate dehydrogenase  57.11 
 
 		 421 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00610824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  56.7 
 
 		 749 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  54.2 
 
 		 759 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  54.2 
 
 		 759 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4071  malic enzyme  58.55 
 
 		 771 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  54.2 
 
 		 759 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  54.2 
 
 		 759 aa  439  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2731  malic enzyme  54.2 
 
 		 759 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2911  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  54.28 
 
 		 755 aa  438  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  55.64 
 
 		 758 aa  441  9.999999999999999e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2616  malic enzyme  54.2 
 
 		 759 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2838  malic enzyme  54.2 
 
 		 759 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3684  malic enzyme  54.2 
 
 		 759 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.392037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  54.2 
 
 		 759 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  54.2 
 
 		 759 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  54.2 
 
 		 759 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  54.2 
 
 		 759 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2654  malic enzyme  56.04 
 
 		 751 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.820528 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02316  hypothetical protein  54.2 
 
 		 759 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  54.2 
 
 		 759 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  53.24 
 
 		 759 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1209  oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase (NADP(+)) phosphate acetyltransferase  54.72 
 
 		 761 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000448619 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  52.76 
 
 		 764 aa  436  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2300  malate dehydrogenase  55.36 
 
 		 414 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1243  malic enzyme  52.64 
 
 		 769 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0540  malate dehydrogenase  57.36 
 
 		 422 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2058  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  55.39 
 
 		 478 aa  437  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.384366  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4217  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  56.35 
 
 		 764 aa  435  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.665335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  53.96 
 
 		 759 aa  435  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2224  malic enzyme  53.61 
 
 		 759 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02395  malic enzyme  53.77 
 
 		 769 aa  431  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766678  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  53.83 
 
 		 757 aa  431  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4423  malate dehydrogenase  53.27 
 
 		 415 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3291  malic enzyme  57.89 
 
 		 754 aa  433  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442539  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  55.75 
 
 		 763 aa  432  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2378  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  57.11 
 
 		 406 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0813409  normal  0.0779687 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1573  malic enzyme  53.96 
 
 		 759 aa  434  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  54.77 
 
 		 754 aa  434  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0295  malic enzyme  53.53 
 
 		 764 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43250  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  55.97 
 
 		 414 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.413003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  51.92 
 
 		 776 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0265  malic enzyme  53.53 
 
 		 764 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.8165  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4123  malate dehydrogenase  54.66 
 
 		 422 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0085913  hitchhiker  0.00000090727 
 
 
-
 
NC_002978  WD0488  NADP-dependent malic enzyme  54.35 
 
 		 440 aa  430  1e-119  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3213  malic enzyme  54.84 
 
 		 759 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3292  malic enzyme  53 
 
 		 759 aa  431  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  54.09 
 
 		 773 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>