More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2094 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  92.88 
 
 		 364 aa  667    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  100 
 
 		 365 aa  731    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0153  recombinase A  84.66 
 
 		 344 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1845  recombinase A  82.65 
 
 		 343 aa  570  1e-161  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1669  recombinase A  82.65 
 
 		 343 aa  570  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2047  recombinase A  81.76 
 
 		 343 aa  565  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.161674  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0201  recombinase A  82.3 
 
 		 345 aa  559  1e-158  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.911025  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1787  recombinase A  84.31 
 
 		 348 aa  555  1e-157  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.744188  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2236  recA protein  78.01 
 
 		 347 aa  540  9.999999999999999e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2002  recombinase A  75.37 
 
 		 345 aa  533  1e-150  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  66.09 
 
 		 355 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  71.12 
 
 		 336 aa  479  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  71.75 
 
 		 338 aa  474  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  66.77 
 
 		 379 aa  472  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  65.59 
 
 		 357 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  65.89 
 
 		 343 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  65.91 
 
 		 366 aa  474  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  65.49 
 
 		 350 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  71.75 
 
 		 338 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0291  recA protein  67.14 
 
 		 363 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0355806  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  64.55 
 
 		 424 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  64.55 
 
 		 361 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5503  recA protein  69.58 
 
 		 363 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  68.94 
 
 		 356 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  63.48 
 
 		 364 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  64.55 
 
 		 361 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  64.94 
 
 		 362 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  65.16 
 
 		 363 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  67.07 
 
 		 361 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  69.09 
 
 		 341 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  64.59 
 
 		 364 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  64.59 
 
 		 363 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  64.87 
 
 		 363 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  65.78 
 
 		 357 aa  465  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  65.87 
 
 		 360 aa  465  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  66.87 
 
 		 347 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  66.09 
 
 		 359 aa  467  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  65.99 
 
 		 347 aa  465  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  62.93 
 
 		 362 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  64.58 
 
 		 347 aa  463  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  67.17 
 
 		 357 aa  463  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  68.01 
 
 		 360 aa  464  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  64.31 
 
 		 362 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  63.94 
 
 		 361 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  65.9 
 
 		 366 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  66.67 
 
 		 365 aa  459  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  62.32 
 
 		 362 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  65.62 
 
 		 366 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2228  recA protein  64.8 
 
 		 363 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  66.46 
 
 		 341 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  65.9 
 
 		 366 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  63.85 
 
 		 363 aa  460  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  62.83 
 
 		 379 aa  459  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  64.43 
 
 		 356 aa  459  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  65.94 
 
 		 358 aa  455  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  66.87 
 
 		 345 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  63.27 
 
 		 362 aa  455  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  65.24 
 
 		 358 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  65.42 
 
 		 355 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  65.95 
 
 		 345 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  66.26 
 
 		 348 aa  456  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  63.95 
 
 		 347 aa  455  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  62.32 
 
 		 362 aa  455  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  66.15 
 
 		 343 aa  456  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  66.87 
 
 		 345 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  67.46 
 
 		 349 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  66.77 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  65.43 
 
 		 348 aa  454  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  65.43 
 
 		 348 aa  454  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  66.77 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  65.09 
 
 		 348 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  66.77 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  66.77 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  66.77 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  66.46 
 
 		 356 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  66.77 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3948  recA protein  66.47 
 
 		 384 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0219  recombinase A  70.66 
 
 		 333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  64.42 
 
 		 383 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  64.85 
 
 		 358 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  65.82 
 
 		 344 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  63.53 
 
 		 376 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  66.46 
 
 		 348 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  64.83 
 
 		 365 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  65.34 
 
 		 346 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  66.77 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  63.56 
 
 		 352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  69.11 
 
 		 338 aa  448  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  64.55 
 
 		 358 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  66.56 
 
 		 335 aa  449  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  65.03 
 
 		 345 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  64.65 
 
 		 358 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  62.73 
 
 		 418 aa  448  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  63.82 
 
 		 347 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  62.14 
 
 		 358 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  65.03 
 
 		 345 aa  449  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  62.03 
 
 		 350 aa  448  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  68.92 
 
 		 346 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  63.02 
 
 		 351 aa  449  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  65.55 
 
 		 357 aa  447  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>