65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1919 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1919  cytochrome c subfamily protein  100 
 
 		 346 aa  713    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1816  hypothetical protein  80.8 
 
 		 349 aa  590  1e-167  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1450  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  57.8 
 
 		 341 aa  422  1e-117  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20363  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  48.82 
 
 		 374 aa  364  1e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0545  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  49.08 
 
 		 374 aa  362  6e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1199  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  48.56 
 
 		 374 aa  347  2e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1236  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  48.33 
 
 		 367 aa  345  8e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1833  cytochrome c subfamily protein  49.13 
 
 		 288 aa  340  2e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.135185  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0742  cytochrome c subfamily protein  49.13 
 
 		 288 aa  340  2e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1095  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome c1 subunit  45 
 
 		 375 aa  335  7.999999999999999e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1919  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  38.69 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233751  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  35.55 
 
 		 278 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0572  cytochrome c1  24.57 
 
 		 233 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834423  normal  0.355949 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0803  cytochrome c1  25 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000755074  hitchhiker  0.00778647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3534  cytochrome c1  24.4 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000922213  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4164  cytochrome c1  24.89 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0116839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0751  cytochrome c1  23.81 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0993  cytochrome c1  24.64 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.697791  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1535  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  20.08 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000513902  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3199  cytochrome c1  22.87 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.663491  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3426  cytochrome c1  21.21 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0003058  normal  0.104383 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0604  cytochrome c1  21.21 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000593  normal  0.0809473 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0603  cytochrome c1  21.21 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00000571786 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0610  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  22.06 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3019  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  20.61 
 
 		 232 aa  54.3  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0297  cytochrome c1  20.92 
 
 		 240 aa  53.5  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434279  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3274  cytochrome c1  20.78 
 
 		 232 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0283583  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1831  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  23.13 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2217  cytochrome c1  19.27 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0564  cytochrome c1  21.08 
 
 		 231 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000336048  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2353  cytochrome c1  22.92 
 
 		 233 aa  50.4  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.922589  hitchhiker  0.000000000801731 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3704  cytochrome c1  21.08 
 
 		 231 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00197574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2731  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  22.92 
 
 		 233 aa  50.4  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0309003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3887  cytochrome c1  21.65 
 
 		 232 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3761  cytochrome c1  21.65 
 
 		 232 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000196164  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0156  cytochrome c1  23.49 
 
 		 285 aa  49.7  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.221677 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0127  cytochrome c1  20.9 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0525293  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0107  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  20.17 
 
 		 245 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00110393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2468  cytochrome c1  19.7 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0366705  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3305  cytochrome c1  24.83 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00885  ubiquinol-cytochrome c reductase  19.46 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2660  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome C1  17.81 
 
 		 245 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0667489  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2758  hypothetical protein  20.83 
 
 		 248 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2631  hypothetical protein  20.83 
 
 		 246 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4690  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  17.95 
 
 		 260 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222111  normal  0.0239811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2966  cytochrome c1  19.9 
 
 		 257 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004507  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase cytochrome C1 subunit  19.05 
 
 		 245 aa  47  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  18.39 
 
 		 747 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1070  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  25 
 
 		 252 aa  46.6  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3694  cytochrome c1  20.8 
 
 		 251 aa  46.2  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0137  cytochrome c1  20.55 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.148946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57540  putative cytochrome c1 precursor  18.98 
 
 		 260 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2872  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  17.27 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0293144  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  18.38 
 
 		 259 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5001  putative cytochrome c1 precursor  18.98 
 
 		 260 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112049  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3228  cytochrome c1  18.96 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0522  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.48 
 
 		 252 aa  43.9  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0503999  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0416  putative cytochrome C1 transmembrane protein  21.08 
 
 		 251 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03201  putative ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  36.17 
 
 		 107 aa  43.5  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000484188  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3542  cytochrome c1  30.38 
 
 		 251 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608845  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13080  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  18.8 
 
 		 259 aa  43.5  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3091  cytochrome c1  19.52 
 
 		 247 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1140  cytochrome c1  21.27 
 
 		 252 aa  43.1  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0717268  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0791  cytochrome c1  22 
 
 		 251 aa  43.1  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.174357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0754  cytochrome c1  22 
 
 		 251 aa  42.7  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>