70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1600 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1600  para protein  100 
 
 
486 aa  984    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1678  putative methyltransferase  54.47 
 
 
508 aa  547  1e-154  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0579  methyltransferase  38.87 
 
 
523 aa  325  1e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.795709  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2284  dimethyladenosine transferase  35.13 
 
 
518 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1377  Methyltransferase type 12  32.43 
 
 
494 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1637  methyltransferase, putative  34.02 
 
 
521 aa  220  3e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1624  Methyltransferase type 12  37.94 
 
 
542 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1482  putative methyltransferase  40.06 
 
 
514 aa  211  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1897  Methyltransferase regulatory domain, predicted  39.5 
 
 
564 aa  210  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  34.94 
 
 
535 aa  189  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  36.56 
 
 
535 aa  189  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  37.26 
 
 
535 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0277  SAM-dependent methyltransferase  35.34 
 
 
482 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0697  hypothetical protein  30.4 
 
 
509 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  31.48 
 
 
1144 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1732  hypothetical protein  28.32 
 
 
503 aa  149  9e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.228081  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1912  methyltransferase type 12  28.48 
 
 
419 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 
1143 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0475  methyltransferase type 12  26.16 
 
 
499 aa  124  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  37.57 
 
 
252 aa  123  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0362  methyltransferase type 12  28.27 
 
 
518 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72532  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  26.77 
 
 
1116 aa  92  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1066  methyltransferase type 11  23.69 
 
 
511 aa  83.2  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0031  hypothetical protein  23.36 
 
 
510 aa  77  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878298  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1398  hypothetical protein  25.73 
 
 
590 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1462  hypothetical protein  30.43 
 
 
499 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1222  hypothetical protein  30.43 
 
 
499 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0351348  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0189  hypothetical protein  30.43 
 
 
499 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0465  hypothetical protein  30.43 
 
 
499 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1110  hypothetical protein  30.43 
 
 
499 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2605  hypothetical protein  29.71 
 
 
499 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1375  hypothetical protein  29.71 
 
 
499 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37000  SAM-dependent methyltransferase  26.19 
 
 
488 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0432577  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3839  methyltransferase type 11  23.33 
 
 
511 aa  66.6  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0810259 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3078  methyltransferase type 12  22.93 
 
 
512 aa  66.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2227  hypothetical protein  24.83 
 
 
514 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.642129  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3432  hypothetical protein  22.37 
 
 
507 aa  59.7  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468772  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4840  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
341 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531482  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5066  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.69 
 
 
367 aa  48.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1487  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.09 
 
 
424 aa  47.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4615  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.93 
 
 
398 aa  47  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  26.2 
 
 
440 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3143  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.35 
 
 
392 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.860131  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  27.78 
 
 
258 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1979  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.92 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157021  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  35.38 
 
 
230 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1741  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  26.92 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000985  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1875  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  26.92 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000001342  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01632  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase (unsaturated-phospholipid methyltransferase)  26.92 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1968  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  26.92 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000279538 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1536  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  26.92 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0998383  hitchhiker  0.00855528 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01622  hypothetical protein  26.92 
 
 
327 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2730  methyltransferase type 12  21.13 
 
 
422 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184055  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  32.46 
 
 
205 aa  45.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0329  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  24.48 
 
 
376 aa  45.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0358  cyclopropane fatty acid synthase family protein  26.28 
 
 
406 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000119082  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1060  cyclopropane fatty acid synthase family protein  26.28 
 
 
406 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189279  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0658  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.28 
 
 
406 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0338601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2493  cyclopropane fatty acid synthase family protein  26.28 
 
 
406 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000280606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0900  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.28 
 
 
406 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0491432  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0903  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.28 
 
 
406 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00630694  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0106  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.28 
 
 
406 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0000308019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0716  cyclopropane fatty acid synthase family protein  26.28 
 
 
406 aa  44.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000471122  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2012  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.84 
 
 
414 aa  44.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0460  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.71 
 
 
421 aa  44.3  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0358  hypothetical protein  25.83 
 
 
258 aa  44.3  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1859  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  25.96 
 
 
382 aa  43.9  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286761  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2374  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  25.96 
 
 
382 aa  43.9  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.049386  normal  0.0849585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  37.36 
 
 
274 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4728  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.45 
 
 
409 aa  43.1  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.228572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>