More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0743 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0743  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
379 aa  754    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.276472  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0409  oxidoreductase with FAD/NAD  62.33 
 
 
383 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2128  hypothetical protein  98.96 
 
 
193 aa  389  1e-107  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1509  HI0933 family protein  44.88 
 
 
379 aa  335  5e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000081979  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1736  HI0933-like protein  41.15 
 
 
384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  36.87 
 
 
394 aa  239  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  38.72 
 
 
397 aa  236  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  37.63 
 
 
397 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  37.14 
 
 
393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  38.94 
 
 
397 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  35.73 
 
 
402 aa  231  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  36.59 
 
 
399 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  38.19 
 
 
398 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  36.69 
 
 
413 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  38.19 
 
 
460 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1635  hypothetical protein  37.56 
 
 
405 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  37.94 
 
 
460 aa  227  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  37.37 
 
 
398 aa  226  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  35.44 
 
 
398 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  36.2 
 
 
394 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  35.44 
 
 
398 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  35.44 
 
 
398 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 
401 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  35.44 
 
 
398 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  35.44 
 
 
398 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1530  hypothetical protein  35.97 
 
 
391 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  35.95 
 
 
392 aa  222  7e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  36.36 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0499  HI0933 family protein  35.73 
 
 
398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0205832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  34.42 
 
 
406 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  36.59 
 
 
399 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  35.61 
 
 
393 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  35.84 
 
 
393 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2884  HI0933-like protein  35.94 
 
 
414 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2439  hypothetical protein  36.32 
 
 
397 aa  216  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  35.95 
 
 
394 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  35.64 
 
 
392 aa  216  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  36.84 
 
 
394 aa  216  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2846  hypothetical protein  34.15 
 
 
413 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  33.59 
 
 
394 aa  215  9e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2335  HI0933 family protein  33.91 
 
 
413 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00707215  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  35.44 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  37.85 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  38.11 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0592  HI0933 family protein  34.74 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1400  hypothetical protein  34.47 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.615162  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  35.7 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  35.31 
 
 
414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  35.19 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  35.95 
 
 
394 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  33.58 
 
 
393 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  35.93 
 
 
392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  36.25 
 
 
394 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0271  hypothetical protein  35.26 
 
 
401 aa  212  7e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  35.99 
 
 
394 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  35.81 
 
 
396 aa  212  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  33.75 
 
 
405 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  36.07 
 
 
396 aa  212  7.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  36.25 
 
 
394 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  35.03 
 
 
394 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2097  hypothetical protein  33 
 
 
419 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234168  normal  0.897923 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  36.13 
 
 
411 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0202  HI0933-like protein  35.14 
 
 
433 aa  211  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.309698  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  35.68 
 
 
397 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3906  hypothetical protein  34.47 
 
 
397 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3800  hypothetical protein  35.97 
 
 
391 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225042  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  34.29 
 
 
393 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  35.95 
 
 
396 aa  209  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  34.01 
 
 
393 aa  209  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  35.58 
 
 
392 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  34.46 
 
 
396 aa  209  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3283  HI0933-like protein  34.47 
 
 
416 aa  209  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3115  FAD-dependent oxidoreductase of HI0933-like family protein  36.71 
 
 
400 aa  209  9e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  35.46 
 
 
428 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1232  hypothetical protein  35.04 
 
 
402 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0902529  normal  0.743867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  35.58 
 
 
392 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1441  HI0933-like protein  34.09 
 
 
394 aa  207  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2555  hypothetical protein  36.98 
 
 
396 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00730633  hitchhiker  0.0000156467 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  34.29 
 
 
394 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1007  hypothetical protein  33.85 
 
 
389 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1308  HI0933 family protein  31.98 
 
 
426 aa  203  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0313133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  35.55 
 
 
393 aa  203  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0183  hypothetical protein  34.52 
 
 
438 aa  202  6e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2218  putative transmembrane protein  33.77 
 
 
412 aa  202  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  32.73 
 
 
394 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3694  HI0933-like protein  34.34 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  35.64 
 
 
394 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1860  HI0933-like protein  33.42 
 
 
381 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.479593  normal  0.0118098 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4838  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  34.48 
 
 
400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  34.52 
 
 
392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1634  HI0933-like protein  34.13 
 
 
392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0131276  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0512  hypothetical protein  34.92 
 
 
410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4212  hypothetical protein  35.66 
 
 
394 aa  199  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0830  HI0933 family protein  33.33 
 
 
419 aa  199  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  33.25 
 
 
399 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  35.19 
 
 
393 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5002  hypothetical protein  35.19 
 
 
393 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.32275  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2030  HI0933 family protein  33.96 
 
 
407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  34.45 
 
 
392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  35.29 
 
 
393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>