88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1097 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1097  hypothetical cytosolic protein  100 
 
 
279 aa  577  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33350  hypothetical protein  66.42 
 
 
324 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.142175 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1460  CRISPR-associated Cas1 family protein  68.84 
 
 
329 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1209  CRISPR-associated Cas1 family protein  67.64 
 
 
337 aa  388  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2447  CRISPR-associated protein Cas1  70.29 
 
 
325 aa  388  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.43322  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0489  CRISPR-associated Cas1 family protein  68.38 
 
 
334 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.121384 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3659  CRISPR-associated protein Cas1  62.5 
 
 
326 aa  368  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208917  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0696  CRISPR-associated protein Cas1  61.03 
 
 
333 aa  363  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0734  CRISPR-associated protein Cas1  60.66 
 
 
333 aa  361  8e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1535  CRISPR-associated protein Cas1  61.4 
 
 
326 aa  355  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1644  CRISPR-associated Cas1 family protein  61.4 
 
 
326 aa  355  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1728  hypothetical protein  61.4 
 
 
326 aa  355  5.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00792911  hitchhiker  0.000413169 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1401  CRISPR-associated Cas1 family protein  59.04 
 
 
325 aa  351  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612871  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2837  hypothetical protein  58.82 
 
 
322 aa  327  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0052  hypothetical protein  58.82 
 
 
322 aa  326  3e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.553204  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1942  hypothetical cytosolic protein  56.93 
 
 
322 aa  319  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3377  CRISPR-associated Cas1 family protein  55.4 
 
 
325 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000538903 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3241  CRISPR-associated Cas1 family protein  55.4 
 
 
325 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1819  CRISPR-associated Cas1 family protein  55.4 
 
 
325 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2751  hypothetical protein  44.85 
 
 
295 aa  232  5e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00117385  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1977  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.81 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147845  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17190  CRISPR-associated protein, Cas1 family  26.72 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.866435  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0946  CRISPR-associated protein Cas1  27.35 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.291315  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0983  CRISPR-associated protein Cas1  25.56 
 
 
314 aa  65.1  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2337  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.19 
 
 
307 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00747033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2474  CRISPR-associated protein Cas1  24.64 
 
 
307 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2444  CRISPR-associated protein Cas1  22.96 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  23.33 
 
 
320 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2636  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.5 
 
 
316 aa  63.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0169  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.09 
 
 
313 aa  62.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1286  CRISPR-associated protein Cas1  26.34 
 
 
327 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.71 
 
 
315 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0835  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.38 
 
 
307 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1901  CRISPR-associated protein Cas1  22.51 
 
 
324 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0023  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.93 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408897  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1530  CRISPR-associated protein Cas1  23.76 
 
 
327 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00231307  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0964  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.82 
 
 
306 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  23.1 
 
 
337 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3541  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.36 
 
 
307 aa  56.6  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.608984  normal  0.0531608 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1392  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.74 
 
 
306 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0232  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.19 
 
 
306 aa  56.6  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1375  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.2 
 
 
299 aa  56.2  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00127759  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0928  CRISPR-associated protein Cas1  23.36 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0949  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.3 
 
 
298 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0628062  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2830  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.83 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3585  CRISPR-associated protein Cas1  22.58 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0930  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.49 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.264886  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  24 
 
 
303 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00872  CRISPR-associated protein Cas1  21.51 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0957  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.86 
 
 
305 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0933  CRISPR-associated protein Cas1  21.86 
 
 
305 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0599  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.83 
 
 
303 aa  52.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000773136  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1808  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.68 
 
 
320 aa  52.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3320  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.68 
 
 
320 aa  52.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3755  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.46 
 
 
304 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0765  CRISPR-associated endonuclease Cas1, ECOLI subtype  23.79 
 
 
313 aa  52.4  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2989  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.22 
 
 
309 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.786147  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2685  CRISPR-associated protein Cas1  23.1 
 
 
315 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000995939  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3132  CRISPR-associated protein Cas1  22.3 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2234  CRISPR-associated protein Cas1  22.74 
 
 
297 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2894  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.51 
 
 
305 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0403  CRISPR-associated protein Cas1  22.1 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0402524  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2164  CRISPR-associated protein Cas1  23.46 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0192086  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1592  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.86 
 
 
305 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.328898 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1587  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.08 
 
 
332 aa  50.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0375026  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2883  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.46 
 
 
307 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921772  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0858  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.16 
 
 
255 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3092  crispr-associated protein Cas1  21.43 
 
 
305 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2676  CRISPR-associated protein Cas1  25.42 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3148  CRISPR-associated protein Cas1  21.86 
 
 
305 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3066  CRISPR-associated protein Cas1  21.95 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3249  crispr-associated protein Cas1  21.95 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  20.34 
 
 
333 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0784  CRISPR-associated protein Cas1  23.4 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00721188  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1413  CRISPR-associated protein Cas1  23.73 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0233391  normal  0.0713718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3904  CRISPR-associated protein Cas1  23.25 
 
 
323 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0486  CRISPR-associated protein Cas1  24.56 
 
 
297 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0583925  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3220  cas1: CRISPR-associated protein Cas1  22.42 
 
 
291 aa  46.6  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4008  CRISPR-associated protein Cas1  22.11 
 
 
307 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3057  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.11 
 
 
306 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17300  CRISPR-associated protein, Cas1 family  24.45 
 
 
342 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  20.24 
 
 
330 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5409  CRISPR-associated protein Cas1  23.51 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.031752  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0906  CRISPR-associated protein Cas1  23.21 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  21.25 
 
 
337 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4348  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.39 
 
 
277 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2578  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.35 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0729404 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1602  CRISPR-associated protein Cas1  22.14 
 
 
303 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.19087  normal  0.843574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>