59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2480 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2480  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  350  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435976  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  81.71 
 
 		 178 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4614  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  66.05 
 
 		 185 aa  209  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5496  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  59.12 
 
 		 184 aa  184  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0603  hemerythrin HHE cation binding region  47.92 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2007  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  41.46 
 
 		 164 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2248  hypothetical protein  41.72 
 
 		 161 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  44.38 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  42.21 
 
 		 158 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  41.56 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1486  hemerythrin HHE cation binding region  44.3 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3879  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  41.46 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  42.25 
 
 		 195 aa  104  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1421  hemerythrin HHE cation binding region protein  40.99 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0180  hemerythrin HHE cation binding region protein  42.31 
 
 		 166 aa  99  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.77 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  42.58 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3822  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.47 
 
 		 482 aa  94.7  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.91 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.25 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.72 
 
 		 190 aa  72  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1314  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.44 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0858  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.71 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  35.54 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.69 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.33 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4773  hypothetical protein  29.5 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2008  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.28 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.05 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.33 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.26 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  28.45 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2549  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.37 
 
 		 165 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2453  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.37 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4535  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.25 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739296  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.83 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.47 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2404  hemerythrin HHE cation binding region  37.42 
 
 		 158 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3326  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.99 
 
 		 207 aa  50.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  25.66 
 
 		 351 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.34 
 
 		 345 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1791  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.97 
 
 		 346 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02980  conserved hypothetical protein  31.2 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.959027  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2426  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.59 
 
 		 163 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.13977  normal  0.0393648 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2543  hypothetical protein  33.91 
 
 		 216 aa  48.5  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.771916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1404  hemerythrin HHE cation binding protein  35.98 
 
 		 165 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2304  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.65 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  hitchhiker  0.00000533583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3007  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442011  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4228  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24 
 
 		 233 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4679  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.93 
 
 		 235 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3800  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.53 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000606803 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2188  hemerythrin HHE cation binding region  29.23 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.7 
 
 		 147 aa  45.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3032  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1490  hemerythrin hhE cation-binding domain-containing protein  23.33 
 
 		 351 aa  43.5  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2860  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.14 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184327  normal  0.243367 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1828  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.43 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2777  hemerythrin HHE cation binding protein  30.09 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2722  hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.8 
 
 		 154 aa  42  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>